Bikini Dolne to idylliczne podwodne miasteczko. Wieczny optymista SpongeBob wiedzie tu spokojne życie razem ze swoimi przyjaciółmi: lojalną rozgwiazdą Patrykiem, cyniczną ośmiornicą Skalmarem, wiewiórką naukowcem Sandy oraz żądnym pieniędzy skorupiakiem panem Krabsą. Wszystko jednak się zmienia, kiedy pirat Burgerobrody (Antonio Banderas) wykrada z Bikini Dolnego sekretny przepis na kraboburgery.