Po serii zamachów bombowych z użyciem dronów zespół S.W.A.T. zaczyna współpracować z porucznik Piper Lynch, znaną detektyw z komendy w Hollywood. Na zlecenie pani burmistrz Piper koordynuje działania różnych służb. Hondo dobrze sobie radzi jako opiekun prawny nastoletniego Darryla, ale w życiu prywatnym mężczyzny pojawiają się komplikacje.

Na polecenie pani burmistrz porucznik Lynch dokonuje przeglądu, który ma usprawnić pracę jednostki specjalnej S.W.A.T. i zmniejszyć koszty. Dzieje się to w tym samym czasie, gdy bohaterowie serialu próbują schwytać niebezpieczną kobietę - przywódczynie sekty, uciekinierkę ze szpitala psychiatrycznego.

Porucznik Lynch chce, żeby S.W.A.T. zlikwidował groźny gang. Nie pozostawia jednak zespołowi czasu na przygotowanie się do akcji. Bandyci mają zostać zatrzymani podczas odbioru fałszywych pieniędzy. W domu Harrelsona narasta napięcie. Stosunki między jego rodzicami, walczącymi o względy Darryla, są coraz gorsze.

Agenci S.W.A.T. próbują zatrzymać przywódcę kartelu wykorzystującego targ kwiatowy do przerzutu narkotyków. Rodzina Deacona jest w niebezpieczeństwie. Były przywódca kolumbijskich partyzantów znajduje się teraz pod opieką CIA. Hondo dowiaduje się o chorobie ojca. Tan staje przed komisją etyki po tym, gdy jego dziewczyna nieopatrznie zostawiła na stole ciasteczka z marihuaną.

Jamajski gang przechwytuje ciężarówkę pełną broni automatycznej przeznaczonej do zniszczenia. Przestępcy planują sprzedać ją gangom w Long Beach. Plan Luki z food truckiem zaczyna nabierać kształtu. Ojciec Hondo otrzymuje diagnozę.

Spotkanie rodzinne Harrelsonów nie przebiega zgodnie z planem. Starsza siostra Hondo z niechęcią przybywa na miejsce, by po raz pierwszy od lat spotkać się ze schorowanym ojcem. Zespół poszukuje porwanego aktywisty na rzecz praw człowieka. Luca ma problem z realizacją planu biznesowego.

Zespół S.W.A.T. próbują schwytać złodziei, którzy ukradli lancę termiczną mogącą przeciąć niemal każdy materiał. Bandyci, którzy nie wahają się strzelać do ludzi, wymykają się obławie, jak gdyby zostali o niej uprzedzeni. Trzeba zidentyfikować miejsce planowanego przez przestępców napadu, w którym ma zostać użyte potężne narzędzie.

S. W. A. T. jest gotowy do szturmu na dom latynoskiej rodziny, która stawiła opór podczas próby eksmisji. Fuentesowie wzięli jako zakładnika rannego zastępcę szeryfa. Okazuje się, ze w domu jest także niemowlę, więc Hicks do końca stara się negocjować i decyduje się na niekonwencjonalny krok.

Urywa się kontakt z funkcjonariuszką z Wydziału Przestępczości Zorganizowanej, która pod przykryciem rozpracowuje węgierski gang handlarzy żywym towarem. Telefony przestępców przestały działać, co oznacza, że zdemaskowali policjantkę. S. W. A. T. poproszono o pomoc w odbiciu Avy, ale najpierw trzeba ją znaleźć. Chris zgłasza się na ochotnika do opieki nad rodzicami porwanej.

S. W. A. T. ochrania przypadkowo rozpoznanego zbrodniarza wojennego z Somalii, do czasu ekstradycji do Trybunału w Hadze, gdyż ofiary Adena Syeda z czasów wojny domowej już przeprowadziły zamach na jego życie. Zgodnie z radą Hondo jego ojciec stara się, niezbyt udanie, poprawić stosunki z byłą żoną. Przyszywany brat Streeta prosi go o pomoc.

Zespół Honda jedzie do napadu na kasyno, jednak bandytom udaje się uciec. Dzięki zaczopowanym sztonom policjanci docierają do sprawców. Po udanym szturmie dostają wiadomość, że ten sam gang właśnie dokonał kolejnego napadu. Dokładne przejrzenie nagrań prowadzi do zaskakującego wniosku. Szef Nate'a, Nolan, szantażem zmusza Streeta do współpracy. Po kłótni z Hicksem Street odchodzi ze S. W. A. T.

Serial opowiada o rodowitym mieszkańcu Los Angeles i poruczniku w jednostce policyjnej S.W.A.T., który zostaje dowódcą elitarnej jednostki bojowej mającej położyć kres działalności kryminalnej w mieście i musi działać rozdarty pomiędzy lojalnością do środowiska ulicy a poczuciem obowiązku wobec swoich przełożonych.

Na prośbę japońskich kolegów zespół S.W.A.T. chwyta zbiegłego członka yakuzy ukrywającego się w Los Angeles. Następnie Hondo, Deacon, Tan i Hicks eskortują Kojiego do Tokio. Koji zostaje odbity podczas transportu do aresztu, japoński policjant zostaje ciężko ranny.

Agenci poszukują samotnego strzelca, który zabija kobiety. Nieopodal domu Luca znajduje zwłoki, a przy nich zastaje dwóch mężczyzn. Choć policjant wie, że nie są sprawcami morderstwa, umieszcza ich w areszcie, gdyż zapowiedzieli zemstę na konkurencyjnym gangu. Jedynym sposobem, by zapobiec samosądom jest szybkie znalezienie sprawcy. Lynch namawia Chris, żeby udzieliła wywiadu dla prasy.

Druga praca Deacona przyczynia się do tego, że jednostka SWAT zostaje uwikłana w sprawę porwania żony zawodowego boksera. Młody podopieczny Honda, Darryl, irytuje się z powodu utraty prawa do opieki nad nowonarodzonym synem. Tymczasem Tan przygotowuje swoją dziewczynę, Bonnie, do spotkania z jego matką.

Jednostka SWAT poszukuje porwanego nastolatka, co doprowadza funkcjonariuszy do osoby objętej programem ochrony świadków oraz powstałej kilka dekad temu politycznej grupy ekstremistów. Hondo i jego dziewczyna kłócą się na temat wykładowcy w jej domu kultury. Luca martwi się, że nie jest wystarczająco sprawny, żeby wrócić do służby w terenie, a dowódca Hicks spotyka się z dawno niewidzianym synem.

Wspólna misja funkcjonariuszy SWAT i policyjnego wydziału do walki z gangami w Los Angeles polegająca na zebraniu dowodów przeciwko najgroźniejszym przywódcom gangów w mieście kończy się niepowodzeniem. Jednostka SWAT ma za zadanie ochraniać gości w hotelu, gdzie miało miejsce spotkanie.

Hondo wraz z drużyną walczą z czasem, żeby odnaleźć poprzedniego dowódcę, Williama "Bucka" Spiveya, gdy ten nagle znika. Obawiają się, że mógł popełnić samobójstwo. Poszukiwania Bucka, które kolidują z najtrudniejszą misją jednostki SWAT, pokazano jako retrospekcję, gdy członkowie drużyny otrzymują porady dotyczące problemów psychicznych wynikających z pracy w SWAT.

Zbiegły więzień, którego Tan aresztował za narkotyki, postanowił krwawo się zemścić na wszystkich odpowiedzialnych za jego zatrzymanie. Wątpliwości co do jego wyroku wzrastają w trakcie trwania obławy. Tan odkrywa, że aresztowany w trakcie jego służby w LAPD Vice i skazany na 7 lat diler narkotyków, Conor Pope, obrał go sobie za cel.

Jednostka SWAT ściga parę w stylu "Bonnie i Clyde'a", która chce zdobyć zestaw rzadkich figur szachowych wartych miliony. Sytuacja się komplikuje, gdy łowcy nagród dołączają do poszukiwań. Tymczasem Darryl jest zaskoczony odwiedzinami byłej dziewczyny i swojego syna.

SWAT poluje na grupę przemytników narkotyków, którzy rozbijają samolot na przedmieściach Los Angeles, gdy współpraca z DEA zakończyła się niepowodzeniem. Ponadto Hondo próbuje pogodzić się z Nichelle, Luca stresuje się przed powrotem do pracy w terenie, natomiast Deacon waha się, gdy zostaje poproszony o poprowadzenie wykładu dla grupy rekrutów na temat zdrowia psychicznego.