Après que plusieurs personnes ont été empoisonnées à la ricine, l'équipe se lance à la recherche du tueur, qu'elle croit lié à un complot éco-terroriste. Deux hommes, exclus d'un mouvement de défense de l'environnement, retiennent leur attention. Pendant ce temps, Maggie continue d'explorer la maternité...

Un attentat à la bombe dans un restaurant fait plusieurs victimes, parmi lesquelles une députée et un proche d'Isobel. L'équipe doit arrêter le terroriste avant qu'il ne commette une autre attaque. L'enquête mène le FBI à s'intéresser à un forum de discussion anarchiste et à une espionne russe...

Après qu'un employé de l'armée américaine a été abattu dans une zone industrielle, l'équipe s'efforce de retrouver le tueur, ce qui permet de mettre en lumière un complot plus vaste. Pendant ce temps, Tiffany continue de faire face à la culpabilité qu'elle ressent à la suite de la mort de Hobbs...

Dans le cadre d'une enquête sous couverture, Scola et Nina se font passer pour un couple marié. Pendant ce temps, le reste de l'équipe tente de retrouver les criminels qui ont torturé et tué un agent du FBI à la retraite qui travaillait pour une société de sécurité...

Après le meurtre d'un agent de sécurité de la FDIC qui se portait au secours de Denise Mamet, une femme enceinte en danger, l'équipe du FBI se lance à la recherche de la future mère et du tueur qui l'a prise en otage. Les policiers découvrent que Denise est la fille du gourou d'une secte...

L'équipe du FBI se retrouve plongée dans une affaire hautement politique qui touche de près OA après que plusieurs talibans ont été abattus et kidnappés sans qu'aucune trace de leur entrée dans le pays n'ait été relevée. Les policiers remontent jusqu'à un dentiste dont le fils est prisonnier en Afghanistan...

Lorsqu'un routier est assassiné et que la drogue qu'il transportait disparaît, le FBI se lance à la recherche des trafiquants qui écoulent ce produit dans les rues de New York. Une véritable course contre la montre s'engage dès lors pour tenter de les mettre hors d'état de nuire le plus rapidement possible et intercepter leur sinistre chargement avant qu'il ne disparaisse...

Le groupe terroriste somalien responsable de la mort de l'agent Hobbs réapparaît, planifiant une attaque d'envergure sur le sol américain. L'équipe du FBI se lance dans une course contre la montre pour les neutraliser, tandis que Tiffany affronte enfin le meurtrier de son ancien collègue...