Un terrible accident se produit à la fin du mariage de Nathan et d’Haley, ce qui a pour conséquence d’envoyer trois personnes à l’hôpital – et de changer les choses pour pas mal de monde à Tree Hill.

Brooke fête son anniversaire avec Rachel. Nathan est témoin d'un événement surnaturel. Dan voit le mot "assassin" partout.

Nouvelles relations : Skillz va chez les Ravens, Peyton rencontre son demi-frère Derek, Rachel choisit Nathan.

Nathan se déchaîne à moto, Rachel pose pour Maxim et Brooke est enceinte.

Amour fraternel. La relation de Peyton avec son demi-frère prend un tour sombre et terrifiant. Nathan reçoit deux nouvelles importantes, l’une est fantastique mais l’autre… il ne sait pas quoi en penser.

Activités extra-scolaires. Lucas rejoint l’équipe de basket… Un homme mystérieux s’intéresse au destin de l’équipe. Et Brooke va passer beaucoup de temps avec son nouveau petit ami à l’école. Forcément : c’est son prof d’anglais.

Tandis que les autres s’impliquent dans des petits délits et des activités pas nettes, Nathan touche le jackpot : il doit 15 000$ à un parieur sans pitié juste avant les demi-finales… et le parieur a misé gros sur le jeu.

Le banquet annuel pour la remise des prix de basketball est un moment important pour Nathan. Et, au gré des espoirs partagés et déçus, il l’est également pour Brooke, Peyton, Lucas, Haley, Rachel et Derek.

Comment sauver sa famille et sa carrière ? Abandonner la compétition au niveau régional. Daunte compte sur Nathan pour perdre un grand match, mais Lucas et Skills fomentent un plan pour gagner.

Tandis qu’on joue It’s a Wonderful Life, chanson traditionnelle pour les fêtes de Noël, sur les écrans de contrôle de l’hôpital, Lucas, gravement malade, comprend ce que deviendrait Tree Hill sans lui.

Une nouvelle imprévue permet à Dan de sortir de prison. Le plan « draps noués puis jetés à travers la fenêtre » permet à Deb de s’échapper du centre de désintoxication. Brooke et Rachel réussissent un examen de mathématiques.

Nathan a besoin d'un job. Skills lui suggère de devenir strip-teaseur. Lucas se pose des questions sur ce qui s'est passé le jour où Keith a été tué.

Des couples se forment lors d'une activité de classe où chacun fait passer un entretien à l'autre, mêlant rires, peurs, amours, espoirs et secrets.

Nathan et ses amis dévalisent le bar secret de Deb, et ils réalisent qu’ils ont assez d’alcool pour organiser une fête du tonnerre de Dieu avant le bal de promo, une fête qui ébranle pas mal de monde.

Peyton pique une crise, Brooke a un oeil au beurre noir, Haley a un choc émotionnel, Nathan s’excuse, Mouth a le coeur brisé… et tout le monde doit travailler de concert pour préparer la grande soirée !

C’est le grand soir et tout le monde a un partenaire : Nathan accompagne Haley, Mouth est avec Brooke, Dan est avec Karen. Tout le monde, sauf Lucas. Tout ça parce que Peyton a rendez vous avec... une réalité terrifiante.

Dernier grand voyage : quelques jours avant la cérémonie de remise des diplômes, un message codé de Mouth pousse ses amis à se rendre au Texas, où ils vont retrouver une vieille connaissance… et obtenir une deuxième chance lors d’un bal de promo idéal.

Des histoires sont révélées : Psycho-Derek sur son passé, Lucas sur son scandale de rasage, et le témoin du meurtre de Keith parlant de l'assassin.

La signature du livre de classe apporte son lot d’inscriptions senties et de crêve-coeurs, et donne à Mouth une chance de montrer à quel point il est un vrai ami. Lucas se met en route pour une épreuve de force avec Dan.

Une nouvelle vie démarre pour Nathan, Brooke et la famille Scott, avec diplôme, amour et nouveau membre au programme.

Adieu Tree Hill. Les diplômés se retrouvent pour fêter leur dernière nuit ensemble : la dernière occasion de faire des projets et de réparer les torts. Ils se jurent de se retrouver dans quatre ans exactement.