Un ingénieur, qui a développé un nouveau système de destruction de missiles guidés, a été assassiné. Callen et Sam traquent son collègue, qui entend vendre des informations confidentielles pendant un vol commercial pour Tokyo. Pendant ce temps, Deeks prévoit une rencontre surprise pour Kensi...

L'équipe du NCIS enquête sur Rebecca Larmont, chargée de concevoir une arme nucléaire pour le département de la Défense. Son ex-mari a déclaré posséder des preuves de son implication dans la vente de secrets de la Navy à des gouvernements étrangers. Kensi infiltre le club cubain où le mari travaille...

Un capitaine de la Navy plusieurs fois décoré, Charles Langston, a kidnappé un administrateur qui détournait des fonds. Pour résoudre cette affaire, les agents du NCIS collaborent avec des collègues qu'Hetty a connus pendant la guerre du Viêtnam : les amiraux à la retraite AJ Chegwidden et Sterling Bridges...

L'enquête sur le vol d'un stock d'or d'une valeur de 40 millions de dollars amène l'équipe du NCIS à travailler à nouveau avec les collègues qu'Hetty a connus pendant la guerre du Viêtnam : l'amiral à la retraite AJ Chegwidden, l'amiral Sterling Bridges et le capitaine à la retraite Charles Langston...

La femme de Sam, Michelle, a été enlevée. Ses kidnappeurs demandent la libération immédiate de Tahir Khaled, l'ennemi juré de Sam, en échange d'informations sur la localisation de Michelle. Toute l'équipe du NCIS se mobilise pour libérer l'otage et capturer les criminels avant qu'un malheur n'arrive...

Après le kidnapping de la femme de Sam, celui-ci décide finalement d'agir seul et tente coûte que coûte d'empêcher son ennemi juré, Tahir Khaled, de s'attaquer à nouveau à sa famille. Refusant de le laisser jouer cavalier seul, ses coéquipiers se montrent solidaires et lui viennent en aide...