En 1858, à Bologne, les Mortara sont bouleversés quand la garde pontificale s'introduit chez eux pour enlever leur fils Edgardo, 7 ans. Né dans une famille juive, l'enfant a été baptisé en cachette par sa nourrice lorsqu'il n'avait que six mois. Edgardo doit désormais recevoir une éducation catholique.