Eksperymentalny samolot marynarki wojennej rozbija się na Oahu, a Tennant i jej zespół muszą dowiedzieć się, kto za tym stoi, zanim tajemnice państwowe wyjdą na jaw.

Tennant i NCIS muszą zlikwidować słynny gang międzynarodowych złodziei używających materiałów wybuchowych z czasów II wojny światowej do rabowania opancerzonych ciężarówek.

Kai udaje się pod przykrywką do jednego z najstarszych gangów surferskich na Hawajach, gdy zamordowany zostaje bosman, który próbował pomagać trudnej młodzieży.

Kiedy uwielbiany Paniolo (hawajski kowboj) zostaje zastrzelony podczas jazdy konnej, Jane i jej zespół muszą zdobyć zaufanie społeczności Paniolo, aby znaleźć sprawców.

Kiedy japoński marynarz zostaje zamordowany na amerykańskiej ziemi, NCIS musi znaleźć mordercę, zanim sprawa wywoła kryzys dyplomatyczny.

Kiedy Tennant i NCIS otrzymują zadanie odnalezienia porwanej, podróżującej po świecie gwiazdy mediów społecznościowych, odkrywają, że nie jest ona tym, za kogo uważa ją jej mąż lub jej obserwatorzy.

Kiedy bosman marynarki wojennej zostaje zamordowany, Jane i zespół prowadzą śledztwo, jednocześnie chroniąc przyjaciela i kolegę ofiary.

Kiedy antykapitalistyczny protestujący zostaje zamordowany, Jane i zespół wszczynają śledztwo i zostają wciągnięci w wojnę między eko-aktywistami a miliarderem technologicznym walczącym o kawałek ziemi.

Zespół NCIS bada niewyjaśnioną sprawę związaną z kośćmi z czasów II wojny światowej w 80. rocznicę bombardowań Pearl Harbor. Wszyscy są zszokowani, gdy dowiadują się, że kości należą do 100-letniego ocalałego z ataku.

NCIS spotyka się z zespołem Whistlera podczas śledztwa w sprawie kontenera transportowego wypełnionego przemytniczą bronią.

Po kradzieży dowodów, które miały doprowadzić do ujęcia narkotykowego barona, Lucy udaje się pod przykrywką na podziemny turniej pokera, aby dowiedzieć się, który z hazardzistów stoi za przestępstwem.

Kiedy NCIS bada tajemniczą śmierć inżyniera marynarki wojennej, Josepha Chana, dowiaduje się, że ostatnią osobą, z którą się spotkał, była jego koleżanka, Maggie Shaw, mentorka i przyjaciółka Jane, która została porwana.

Podczas gdy Jane bada sprawę porwania Maggie, jest zszokowana, gdy dowiaduje się prawdy. Aby potwierdzić swoje odkrycia, angażuje swój zespół i Whistlera.

Podczas gdy Jane jest przesłuchiwana po aresztowaniu Maggie Shaw, reszta zespołu bada tajemniczy przypadek żołnierzy piechoty morskiej z uszkodzonymi kanałami słuchowymi przez broń emitującą fale ultradźwiękowe.

Gdy Jesse spędza dzień żeglując ze swoją córką Gracie, piraci nagle przejmują ich jacht, biorą wszystkich pasażerów jako zakładników. Teraz jego zespół musi szybko zlokalizować i uratować jego córkę.

Kai działa pod przykrywką jako szef kuchni w lokalnej restauracji, aby zebrać informacje na temat znanego przestępcy, który ma powiązania z restauracją.

Kiedy próba wyłudzenia okupu powoduje awarię tamy, Ernie i zespół hakerów mają za zadanie szybko znaleźć winowajcę, zanim na wyspie zabraknie energii i wody.

Agenci NCIS Nick Torres i Jessica Knight udają się na Hawaje, gdy dowiadują się, że kluczowy świadek w jednej z ich starych spraw pojawił się tam z ważnymi dowodami.

Zespół NCIS bada katastrofę statku przewożącego egzotyczne zwierzęta, które zagrażają rodzimej przyrodzie na Oahu.

Kiedy marynarz marynarki wojennej zostaje zamieszany w morderstwo, zespół NCIS zostaje wezwany do pracy nad sprawą w dniu wolnym od pracy.

Kapitan Milius powraca na Hawaje, aby wziąć udział w tajnej operacji wymiany więźniów, i sprowadza Jane, aby była jego osobistą eskortą na Filipinach, gdzie odbędzie się wymiana.

Kapitan Milius kontynuuje współpracę z Tennant i jej zespołem po wymianie więźniów między USA a Europą Wschodnią.