Doktor Allen Hynek, astrofizyk z Ohio, zostaje zwerbowany przez amerykańskie lotnictwo. Ma zbadać historię pilota, który przeżył walkę powietrzną z pozaziemskim statkiem latającym.

Dr Hynek i kapitan Quinn badają sprawę z Wirginii Zachodniej: kobieta z dwójką dzieci widziała katastrofę UFO niedaleko swojej farmy. Twierdzą, że z płonącego wraku wydostał się przybysz.

Mieszkańcy Lubbock w Teksasie widzą na nocnym niebie tajemniczy pojazd w kształcie litery V. Hynek i Quinn wyruszają, aby zbadać tę sprawę.

Spotkanie pasażerskiego samolotu z UFO naprowadza Hynka i Quinna na trop tajnego programu pod nazwą "Operacja Paperclip", nad którym pracują między innymi dawni nazistowscy naukowcy.

Hynek i Quinn trafiają na tajną grupę, której członkowie nie tylko widzieli dziwne światła na niebie, ale też twierdzą, że potrafią się z nimi komunikować.

Tajemnicze, zielone kule ogniste doprowadzają do katastrofy nuklearnej w czasie testów nowej broni. Hynek i Quinn muszą zbadać, jak do tego doszło: każdy z nich ma na ten temat własną teorię.

Drużynowy skautów znika po tym, jak wraz z drużyną był świadkiem pojawienia się w lesie dziwnego pojazdu. Hynek bada tę sprawę, podczas gdy Quinn wykonuje specjalne zadanie dla generała Hardinga.

Pojawia się nagranie ukazujące atak UFO na amerykańskich żołnierzy. Hynek i Quinn badają tę sprawę. Okazuje się, że żołnierze odczuwają fizyczne i psychologiczne skutki wojny.

W kwaterze głównej projektu Błękitna Księga pojawia się człowiek, którego żona twierdzi, że został porwany przez kosmitów. Mężczyzna bierze Hynka i Quinna jako zakładników i żąda wyjaśnienia sprawy.

Nad Waszyngtonem pojawia się wiele obiektów UFO. Hynek i Quinn mają zbadać to zjawisko i ocenić potencjalne zagrożenie.