En réaction au débarquement anglo-américain en Afrique du Nord, l'armée allemande envahit la zone sud le 11 novembre 1942. Début 1943, Libération-Sud, Combat et Franc-tireur fusionnent au sein des MUR (Mouvements unis de la Résistance), dirigés par Jean Moulin. En février, sous la pression de Hitler, qui manque de main-d'oeuvre, Laval signe une loi instaurant le Service du travail obligatoire (STO).

Malgré les coups durs et le manque de moyens, la résistance armée prend une ampleur inédite à l'été 1943. En septembre, une unité des FTP-MOI, emmenée par le jeune Marcel Rayman, abat un colonel SS à Paris. Mais un vaste coup de filet de la police française anéantit bientôt le groupe, dirigé par Missak Manouchian.