L'unité enquête sur le vol d'armes dangereuses, découvrant qu'un adolescent a été recruté par des terroristes pour commettre un attentat. Parallèlement, l'agent spécial Omar Adom Zidan doit faire un choix difficile pour protéger sa communauté en risquant sa vie, tout en gérant une forte pression interne au sein du bureau.

Le FBI enquête sur une fusillade qui a eu lieu dans la boutique d'un prêteur sur gage. Le propriétaire du magasin et un officier de police ont été tués. Grâce au bornage des téléphones portables au moment de l'assaut, les enquêteurs remontent jusqu'à un suspect. Celui-ci a pris une photo de la voiture du criminel. Il s'avère que le véhicule a été volé...

Frank Leone, un riche comptable, est abattu en plein jour après avoir secrètement témoigné contre El Feo, un baron de la drogue. Lorsqu'un second meurtre est commis et afin de faire avancer l'enquête, Tiffany demande de l'aide à son ami Ralphie. Celui-ci est un ancien officier du NYPD et le cousin d'El Feo...

Trevor Logan, un adolescent, se présente au siège du FBI avec un grand sac contenant une importante quantité de fentanyl. Il demande à être protégé des hommes qui ont tiré sur son père. Celui-ci, hospitalisé, a confié le sac à son fils en lui demandant de le cacher. Nina fait une proposition à Scola, qui hésite à accepter...

L'équipe enquête sur le meurtre de Cole Dixon, un indic dont le corps a été retrouvé devant une usine désaffectée. Pour en apprendre plus sur lui, Maggie reprend contact avec Gwen Carter, un ancien collègue qui était également l'agent référent de Dixon. Les investigations mènent le FBI jusqu'à un ex-chimiste...

Blessée, Chase est transportée en urgence à l'hôpital. Forrester est chargée de veiller sur elle. De son côté, Jubal est rappelé à New York afin d'aider Scola dans son opération d'infiltration. Ce dernier parvient à obtenir un rendez-vous avec son contact, Andrej Chernin. Mais celui-ci se montre soupçonneux lors de leur entretien et le FBI n'a pas d'autre choix que de l'arrêter...

Le colonel John Sittenfeld, commandant en second d'une base aérienne de la garde nationale, est kidnappé, torturé et forcé de donner les codes d'accès au site. Ses agresseurs dérobent ensuite des missiles antichar. L'équipe doit travailler rapidement pour retrouver les suspects et les armes volées...

L'équipe du FBI collabore avec un lieutenant de police et ami de longue date de Jubal pour retrouver des explosifs militaires volés avant un attentat imminent. Cette enquête hautement difficile met la confiance entre les deux hommes à rude épreuve en réveillant de lourds secrets du passé, compliquant la situation sur le terrain.