Sheldon veut travailler pour l'armée mais Leonard et Howard sont réticents lors d'un rendez-vous avec le colonel Williams.

Amy est dépitée car Sheldon lui impose des règles strictes à la maison. Elle tombe des nues lorsque Sheldon lui propose de fréquenter d’autres personnes.

Les petits secrets entre amis commencent à s’éventer. Amy ment à Sheldon en lui faisant croire que les travaux de son appartement ne sont pas terminés pour continuer à vivre avec lui.

Amy se livre à une expérience en combinant ses cellules cutanées avec celles de Sheldon pour les transformer en un réseau neuronal. Le résultat est spectaculaire ce qui pousse Sheldon à passer à la vitesse supérieure.

La jalousie de Sheldon envers son collègue géologue Bert, qui a reçu un prix prestigieux et une bourse, le pousse à se blesser.

Maintenant que Sheldon et Amy cohabitent, ils veulent redécorer l’appartement. Sheldon commence à se réapproprier tous les objets qui étaient dans son ancien logement au détriment de Leonard.

Sheldon et Amy rendent visite à la mère de Sheldon au Texas afin de lui annoncer qu’ils vivent ensemble. Mais Sheldon se sent trahi car Amy avait déjà prévenu sa mère avant leur arrivée.

Scandalisée, Amy réalise que Sheldon partage des détails intimes de leur relation avec plusieurs personnes.

Les billets d'entrée pour le prochain Comic-Con vont être mis en vente mais les priorités de chacun ont changé.

Rajesh déménage chez Leonard et Howard, Sheldon est jaloux et demande conseil à la mère de Léonard.

Sheldon et Amy décident de collaborer professionnellement, et établissent des règles de base pour que cela se passe au mieux. Mais ils ne semblent faire de progrès qu’en se disputant.

Sheldon décide de travailler avec Amy sur leur projet commun et de continuer ses recherches sur le projet du gyroscope avec Leonard et Howard, dans la même journée. Il partage donc son temps entre les 2 laboratoires et court d’une pièce à l’autre.