Vingt ans après une épidémie fongique dévastatrice, Joel et Tess ont pour mission de changer le cours des choses.

En 2003, un scientifique indonésien fait une terrible découverte. En 2023, Joel et Tess s'échappent de la zone de quarantaine de Boston.

Bill se prépare à affronter la fin du monde seul, mais un inconnu bouleverse ses plans. Des années plus tard, Joel et Ellie lui demandent conseil.

Joel et Ellie abandonnent leur camion à Kansas City et tentent de s'échapper en évitant de se faire repérer par une cheffe rebelle revancharde.

Joel et Ellie croisent l'homme le plus recherché de Kansas City tandis qu'ils essayent d'échapper aux rebelles. Pendant ce temps, Kathleen continue sa chasse.

Joel et Ellie ignorent les avertissements, et cherchent les lucioles et Tommy dans des endroits de plus en plus dangereux.

Joel lutte pour survivre, tandis qu'Ellie se remémore la nuit qui a tout changé.

Après avoir croisé la route d'un groupe de survivants en quête de vengeance, Ellie et sa combativité attirent l'attention de leur chef. Joel, affaibli et toujours en train de lutter pour survivre, doit affronter un groupe de chasseurs assoiffés de sang.

Anna, enceinte, décide de faire confiance à un ami de longue date. Plus tard, Joel et Ellie approchent de la fin de leur voyage.