Un agent de police est tué lors d'un cambriolage. Frank ordonne que son meurtrier soit retrouvé au plus vite. Danny ne tarde pas à soupçonner un certain Angelo et trouve un témoin, une vieille dame. Il pousse cette dernière, hésitante, à confirmer son identité. Cela contrarie fort Erin, chargée de l'affaire...

Un célèbre acteur d'Hollywood, venu observer Danny sur le terrain pour préparer un futur rôle, se fait soudainement poignarder. Pour préserver sa réputation et éviter le déferlement des médias, le détective accepte de mener son enquête dans la plus grande discrétion. En parallèle, Frank inspecte personnellement ses troupes afin de resserrer les liens avec la hiérarchie policière.

Danny enquête sur la mort d'un homme, abattu sous les yeux de son fils. Grâce aux renseignements donnés par l'enfant, Danny réussit à identifier l'assassin. Doté d'un casier judiciaire chargé, l'individu a déjà été condamné pour meurtre. Il n'est pas en prison, la police n'ayant jamais réussi à l'arrêter...

Danny et Baez enquêtent sur la mort d'une adolescente qui aurait été poussée par un sans-abri sur les voies du métro. Pendant ce temps, Frank doit rencontrer la nouvelle inspectrice générale, qui aura en charge la surveillance de la politique sécuritaire menée par la police de New York...

Alors que Nicky et Erin prennent un petit déjeuner dans un restaurant, ils découvrent qu'une petite fille assise à proximité a laissé un mot en partant. Il s'agit d'un appel à l'aide. Danny est appelé en renfort, et apprend vite que les adultes qui accompagnaient l'enfant n'étaient pas ses parents...

Baez enquête afin de récolter des renseignements sur l'ex-petite amie de Danny, qui vendrait de la drogue. Elle n'est pas au bout de ses surprises. De son côté, Jamie doit faire face à des reproches. Il aurait, en effet, provoqué la mort d'un homme. Jamie voulait simplement protéger un garçon en danger...

L'officier de police James Stafford abat un suspect de 14 ans en pleine rue. Lorsque Jamie Reagan débarque sur les lieux, son collègue prétend d'emblée que le jeune homme pointait un revolver sur lui. Aucune arme n'étant retrouvée sur la scène de crime, Stafford est accusé de violences sur mineur...

L'avocat de la mafia Angelo Gallo est abattu par balles lors d'un dîner avec Frank, à la porte d'un restaurant en plein centre-ville. Frank à la vie sauve de peu. Pendant ce temps, Danny est appelé pour être juré dans un procès pour meurtre. Eddie est agressée mais refuse de porter plainte...

Danny et Baez enquêtent sur une affaire d'homicide dont le principal suspect n'est autre que le frère de Baez, un ancien toxicomane. Baez n'avait pas eu de ses nouvelles depuis très longtemps. Frank apprend que l'un de ses bergers allemands, qui fait partie de l'unité K9, est accusé de brutalité policière...

Danny et Baez enquêtent sur un attentat mais doivent faire face aux résistances des habitants, qui ne tient pas à collaborer. Il leur faut pourtant recueillir le plus de témoignages possible. Pendant ce temps, un homme frappe un policier parce qu'il était trop agressif durant son interrogatoire...

La loyauté de Danny est mise à rude épreuve lorsqu'il est contraint de s'occuper d'une affaire concernant Mickey, un ami d'enfance de retour à New York. Celui-ci est soupçonné d'avoir des liens avec une famille de la mafia. Pendant ce temps, Frank apprend que la criminalité est en augmentation...

Quand Danny apprend par Nicky qu'une nouvelle sorte d'héroïne est en circulation, il entame une course effrénée pour remonter jusqu'au distributeur. La drogue provoque des overdoses en série. Pendant ce temps, Frank sort le grand jeu afin de débarrasser les rues de la ville de ces substances létales...

Danny et Maria doivent prendre en filature un vétéran des Marines, que Danny pense atteint de stress post-traumatique. Il s'agit de vérifier qu'il ne se mette pas en danger et qu'il ne représente pas non plus un risque pour les autres. Frank, quant à lui, est pris au dépourvu lors d'une conférence de presse...

Danny et Baez enquêtent sur le meurtre de Tiffany Lamp, célèbre travesti d'une émission de télévision, retrouvée morte dans un parc de la ville. Pendant ce temps, Erin se replonge dans une affaire de drogue après avoir été enlevée par la mère de l'accusé...

Danny et Baez sont amenés à enquêter sur l'enlèvement d'une jeune fille, disparue à la sortie de son école. Cette affaire fait ressurgir de douloureux souvenirs dans l'esprit de Danny, qui a travaillé sur une affaire similaire quelques années auparavant. Frank est en désaccord avec Kelly Peterson...

Danny reçoit l'appel d'une femme en détresse. Elle menace de se suicider en entraînant avec elle celui qui a tué ses parents dans un accident de la route. Frank accompagne son petit-fils Sean lors d'une sortie de classe. Il s'échine à convaincre l'institutrice de lâcher du lest...

Alors qu'ils sont très occupés par une affaire compliquée, Danny et Maria apprennent qu'une femme enceinte a été agressée par des adolescents. Elle est la victime de leur jeu stupide. Ces jeunes s'amusent à frapper violemment à la tête des inconnus qu'ils croisent dans la rue. Danny et Baez enquêtent...

Une femme meurt des suites d'une opération de chirurgie plastique, terrassée par une dose mortelle de lidocaïne. Danny et Baez tentent de démasquer le meurtrier. De son côté, Erin s'essaye au speed dating...

Danny et Baez enquêtent sur le meurtre d'un enseignant respecté, mais impliqué dans un programme scolaire pour le moins discuté. Par ailleurs, Danny découvre que son père ne l'a pas informé d'une enquête menée sur lui par le procureur pour violation de l'éthique et des procédures. Il s'inquiète...

Erin enquête sur une affaire dans laquelle un policier est accusé d'avoir tué un suspect en détention. Frank lui conseille de s'en tenir aux faits afin d'éviter toute mauvaise publicité pour les services de police. Jamie, quant à elle, recommande à Edith de pardonner à son père ses erreurs passées...

Un agent de l'unité de Danny, qui était en mission sous couverture, est abattu. D'après les premiers éléments de l'enquête, la victime avait pas mal de choses à cacher. Frank découvre notamment que le policier cachait un important secret. Par ailleurs, Erin est approché par un drogué qui sollicite son aide...

Danny est écarté d'une enquête et comprend qu'une personne en interne essaie d'étouffer l'affaire. Jamie se retrouve au milieu d'une altercation entre un père polonais et sa fille, sur le point d'épouser un étudiant syrien, qui va bientôt perdre son visa...