Un policier meurt dans un vol à main armée, Frank fait tout pour que la NYPD arrête le suspect.

Le célèbre acteur Russell Berke qui suivi Danny pour préparer son prochain rôle est poignardé. Danny lui porte secours, mais doit rester discret sur cette affaire en raison de la célébrité de Russell.

Danny s'improvise négociateur quand l'informateur d'une affaire de drogue prend Erin en otage au tribunal. Jamie désobéit à son lieutenant et est suspendu, Frank doit trouver une sanction en conséquence.

Danny et Baez enquêtent sur la mort d'une adolescente qui aurait été poussée sur les rails du métro. Frank, lui, n'a guère envie de rencontrer la nouvelle inspectrice générale de la NYPD.

Danny et Baez soupçonnent une fillette d'être victime d'enlèvement, sa mère nie, mais son récit n'est pas cohérent. Frank rend visite à un prêtre, conseiller de la NYPD, arrêté pour conduite en état d'ivresse.

Un gangster meurt après que Jamie le pourchasse pour protéger le garçon dont il est le mentor, sa conduite est remise en question. Baez s'infiltre pour avoir des infos sur le fiancé de l'ex-compagne de Danny, trafiquant dans sa salle de sport.

Un policier est accusé de brutalité sur un suspect, le département de Frank fait l'objet de contrôles par la communauté et le maire.

Après son dîner avec l'avocat de la mafia Angelo Gallo qui se fait tirer dessus, Frank échappe de justesse aux tirs. Danny est appelé sur le bancs des jurés, et son avis ne fait pas l'unanimité lors du procès.

Danny et Baez enquêtent sur un homicide dans lequel le frère de Baez, ancien toxicomane, est le suspect principal. Frank apprend que l'un de ses officiers les plus décorés, un berger allemand de l'unité K9, est accusé de brutalités.

Danny et Baez enquêtent sur l'explosion d'une bombe, mais c'est sans compter sur des tensions communautaires. Frank doit gérer une tempête politique lorsqu'un homme frappe un officier un peu trop agressif lors de son interrogatoire.

La loyauté de Danny est mise à rude épreuve quand on lui confie l'affaire d'un ami d'enfance, Mickey, soupçonné d'avoir des liens avec une célèbre famille de mafieux.

Nicky informe Danny qu'une nouvelle marque nocive d'héroïne foule les rues, ce dernier lance une chasse à l'homme pour trouver le fournisseur. Frank est prêt à tout pour empêcher ce trafic.

Danny et Baez cherchent un vétéran des Marines qu'ils suspectent de souffrir de stress post-traumatique. Frank est pris de cours lors d'une conférence par une femme souhaitant rendre justice à sa fille tuée.

Danny et Baez enquêtent sur le meurtre de Tiffany Lamp, drag queen rendue célèbre par la téléréalité, retrouvée morte dans un parc. Erin réexamine une affaire de drogue pour un procès.

Danny et Baez enquêtent sur le kidnapping d'une jeune fille disparue après l'école, ce qui rappelle de mauvais souvenirs à Danny, qui a travaillé sur une affaire similaire jamais résolue.

Danny reçoit l'appel d'une femme menaçant de se tuer elle, et l'homme qui a tué ses parents dans un accident de la route et court la trouver.

Danny et Baez enquêtent sur une femme enceinte victime du "jeu du K.O.", dans lequel des adolescents frappent des innocents au hasard à la tête. Frank hésite à promouvoir un officier craignant que ce soit vu comme du favoritisme.

Danny et Baez enquêtent sur la mort d'une femme dont le corps a été jeté après avoir été tuée par dose léthale de lidocaïne lors d'une chirurgie esthétique. Frank assigne secrètement Jamie sur une affaire classée et Erin s'essaie au speed dating.

Danny et Baez enquêtent sur le meurtre d'un professeur universitaire respecté impliqué dans un programme de bourse douteux. Danny découvre que le procureur enquêtait sur lui pour violations éthiques et procédurières.

Erin doit enquêter sur l'affaire d'un policier en service accusé d'avoir tué un suspect en garde à vue. Frank lui demande de s'en tenir aux faits pour éviter un scandale sur la NYPD.

Un inspecteur de l'unité de Danny est tué en infiltration, Frank déploie les grands moyens pour trouver le tueur et finir par découvrir que la victime cache de lourds secrets. Jamie et Eddie aident Nicky à retrouver un ancien camarade de classe.

Danny se voit retirer une affaire qui tourne mal, après avoir découvert que l'on tentait d'étouffer la vérité dans le dernier épisode de la saison 4.