La trépidante existence de Sonic bascule lorsqu'un choc avec le redoutable Docteur Eggman chamboule l'équilibre de l'univers. Déterminé à restaurer sa réalité et à secourir ses vieux alliés, il s'élance à travers des mondes mystérieux, entraînant de nouveaux compagnons dans une épopée hors du commun.