A Washington, Jack Bauer collabore avec le FBI pour contrer une attaque terroriste pendant que la présidente Taylor tente de résoudre une crise internationale.

Tandis que Tony et son groupe ont pris le contrôle du trafic aérien, Jack recherche le sniper qui a tué la seule personne capable de localiser le terroriste.

Le colonel Dubaku demande à la Maison Blanche de retirer ses troupes. Pendant ce temps, Tony, interrogé par Jack, lui murmure un ancien nom de code.

Alors que Jack est conduit dans la planque de Bill, Tony et Chloe, Henry Taylor, le mari de la Présidente, retrouve Samantha, l'ancienne fiancée de Roger.

Jack et Tony font sortir Matobo de sa cachette afin qu'il les mène à Dubaku. Walker arrive à ce moment : elle est capturée et emmenée avec le leader sangalais.

Jack tente de gagner la confiance d'Emerson en faisant semblant d'abattre Walker. Il met ensuite Matobo dans la confidence de son plan et obtient son aide.

Jack et son équipe interviennent pour empêcher le sabotage, par Dubaku et ses hommes, d'une usine chimique. Ils y parviennent et libèrent les Matobo.

Jack est à la Maison Blanche, où il s'explique avec la Présidente. Dubaku les appelle et menace de tuer Henry si les Etats-Unis ne se retirent pas du Sangala.

Jack et Renee mettent Dubaku en échec. Ce dernier tente de fuir le pays, mais sa petite amie accepte de collaborer avec les agents du gouvernement.

La tentative de fuite de Dubaku tourne court quand il essaie d'emmener sa petite amie avec lui. Son arrestation permet à Jack d'obtenir de précieux indices. Les agents corrompus du FBI font en sorte d'effacer tous les documents compromettants, mais ils sous-estiment les talents de Chloe...

Informé par Tony, Jack cherche à interroger Ryan Burnett, le directeur de cabinet du sénateur Mayer, au sujet d'un attentat qui se prépare.

Le général Juma et son équipe réussissent à pénétrer dans la Maison Blanche. Ils prennent des otages en espérant capturer la Présidente Taylor.

Alors que la Présidente accepte de faire une déclaration pour libérer sa fille, Jack Bauer se lance sur la piste des conspirateurs, contre l'avis de Larry Moss.

Jack cherche les connections possibles entre le meurtrier de Burnett et ceux qui ont aidé Juma : il sollicite l'aide du sénateur Blaine Mayer.

Jack et Tony continuent leur enquête dans un chantier naval où l'arme biologique développée par Starkwood doit être livrée. Larry réalise que Jack est innocent.

Jack Bauer est pris en charge par une équipe médicale pour déterminer s'il a été exposé ou non au gaz qui s'est échappé de l'arme biologique.

A Starkwood, le FBI est encerclé par les mercenaires de Hodges, qui exige le retrait des troupes de Larry. Jack montre les premiers signes d'une contamination.

L'ultimatum de Hodges a fonctionné et il est accueilli à la Maison Blanche. Au FBI, Renee fait venir Kim Bauer, la fille de Jack, pour sauver son père.

Un mercenaire a pris la fuite avec l'arme biologique. Jack accompagne Renee sur le terrain malgré son état de santé qui ne cesse de se détériorer.

Tony veut convaincre ses comparses d'utiliser la bombe biologique. La Présidente cherche à faire passer Hodges pour mort afin qu'il bénéficie d'une protection.

Alors que Tony et ses hommes veulent faire endosser la responsabilité du prochain attentat à Jibraan, Chloe répertorie les musulmans de la ville.

Jack et Renee tentent de localiser Jibraan car ils savent que le jeune homme est en danger et que l'attentat que prépare Tony est imminent...

Jack est contraint d'aider Tony à s'échapper pour protéger sa fille Kim. A la Maison-Blanche, les soupçons pèsent de plus en plus sur Olivia.

Tony révèle à Jack l'identité du responsable de la conspiration et explique ses motivations. Ethan oblige Olivia à avouer le meurtre de Hodges à sa mère.