Désormais agent triple pour le FBI, Jane doit fournir des renseignements sur le groupe terroriste auquel elle appartenait, et qui prépare une opération de grande ampleur. Weller tente d'éviter les divisions au sein de son groupe et apprend à partager les responsabilités avec Nas...

Jane évoque un souvenir où elle est la seule survivante d'une opération commando en Afghanistan. Elle explique que Shepherd, sa mère adoptive, et Roman, son frère, à la tête de Sandstorm, l'ont mise sur la piste d'un de ses tatouages, représentant des balles utilisées pour perpétrer un massacre...

Après avoir été droguée par Roman, Jane se réveille au Q.G. de Sandstorm. Interrogée par Shepherd, elle lui raconte, comme le lui a conseillé Naz, qu'elle a échappé à Cade qui la retenait prisonnière et la torturait. Mais sa mère adoptive lui demande de prouver sa loyauté à l'égard du groupe...

Les têtes pensantes de Sandstorm essaient de ramener Jane vers le groupe. Le FBI a décrypté un nouveau tatouage, menant à un hacker qui a mis au point un jeu vidéo servant de base à des missions d'infiltration de bâtiments ultra-sécurisés. Reade perd son calme à mesure qu'il cherche à retrouver ses souvenirs...

Un politicien manque de se faire tuer par un assassin à la solde d'un gang irlandais durant un rallye. Allie Knight prête main-forte aux coéquipiers de Weller pour faire tomber le leader du clan. Jane demande à Shepherd l'identité de la femme qui a pris soin d'elle après l'attaque d'Orion...

Weller et Nas se rendent en Bulgarie pour traquer un fugitif. Au domicile de Jones, Zapata trouve Reade devant le cadavre de l'entraîneur. Jugeant les circonstances accablantes pour son ami, elle le dissuade d'appeler la police. Lorsqu'une enquête pour meurtre est ouverte, elle retourne sur la scène de crime...

En 1913, en Indonésie hollandaise, Axel Heyst, un aventurier, vit dans un hôtel du port de Surabaya. Chaque soir, un orchestre, exclusivement composé de jeunes filles, joue dans l'établissement. Les musiciennes sont ensuite vendues aux clients les plus offrants. Axel Heyst décide de sauver l'une des artistes...

Weller et Jane sont engagés pour participés à un braquage commandité par Nico Marconi, un trafiquant d'armes activement recherché. Le malfrat convoite un mystérieux objet, qu'il doit récupérer au cours d'une conférence internationale. Les deux agents disparaissent au cours de l'opération...

Jane accompagne Roman à la base, où elle découvre une facture d'achats d'explosifs et des schémas d'installation électrique. L'équipe en déduit que l'organisation a pour projet de couper l'électricité dans l'ensemble du pays. Il lui faut récupérer Jane et arrêter Roman avant qu'il ne soit trop tard...

Le terroriste Anton Stepulov refait surface à New York. En échange d'informations sur une attaque imminente, la CIA lui a promis une transplantation cardiaque pour son fils. Stepulov retourne sa veste et le FBI tente d'empêcher l'attentat qui doit décimer les participants d'un tournoi de basket...

Jane et Roman infiltrent le gang de bikers de Kat Jarrett, une ancienne idylle de Roman. L'idée est d'arranger un faux cambriolage et de remettre la marchandise à Sandstorm, de façon à arrêter Shepherd. Mais Kat, suspicieuse, accuse bientôt Jane et Roman de collaborer avec la police. Par ailleurs, Reade commence à fréquenter l'ex-petite amie de Freddy...

Toute l'équipe apprend la véritable identité de Shepherd et comprend que celle-ci est liée à Weller depuis des années. Les agents enquêtent sur un dénommé Jared Wisnewski, leader d'un groupe de fermiers militants. Weller réalise que Wisnewski n'est autre qu'un informateur du FBI, enrôlé par Boyd...

Flash-back sur une intrusion de Rich Dotcom, Zach Riley et Boston Arbliss, sur le campus de leur université pour effectuer un piratage informatique. Il se solde par leur arrestation. Un tatouage révèle une mystérieuse formule qui met l'équipe sur les traces d'une société secrète d'anciens étudiants...

Patterson découvre qu'un des tatouages de Jane représente une ancienne pièce de monnaie, dont le motif est la carte de visite d'un mystérieux coursier du dark web qui se fait appeler Lelantos. Le bruit court que Lelantos serait sur le point de préparer une importante livraison à New York...

Nas survit à son agression. Elle devait récupérer une clé USB à un lieu fixé par son contact de Sandstorm. Celui-ci lui demande une importante somme d'argent. L'équipe de Weller parvient à démasquer cet informateur qui se révèle être Cade. Ce dernier apprend à l'équipe que Shepherd l'a séduit...

Jane et Oliver se réveillent en captivité. Leurs ravisseurs, qui comptent profiter des millions détournés par le père d'Oliver, ont l'intention de demander une rançon. Roman retrouve la mémoire : il aurait récupéré de l'argent sur un compte au nom d'Alice Kruger, le nom de naissance de Jane...

Alors que l'équipe fait l'objet d'une enquête et peine à se défendre, elle tente d'élucider une mort mystérieuse survenue au sein d'une famille d'accueil. Les agents soupçonnent les enfants de servir de cobayes pour de nouvelles drogues. Jane tente de persuader Weller de laisser Roman les aider à mener l'enquête. A l'hôpital, Reade confesse ses tourments à un autre patient...

Shepherd s'envole pour Bangkok, où elle compte faire l'acquisition d'armes nucléaires. Weller suit une piste qui pourrait éclaircir l'énigme du tatouage. L'enquête entraîne l'équipe dans une chasse aux trésors orchestrée par deux pirates informatiques. A la clé, une base de données confidentielle...

Les transgressions de Zapata la conduisent tout droit en prison. Il s'agit en réalité d'un subterfuge mis au point par Weller et Patterson, dans le but de soutirer des informations à Devon, une trafiquante d'armes proche de Sandstorm. Patterson ne parvient plus à maîtriser ses sautes d'humeur...

Reade songe à quitter New York. Roman, de nouveau placé sous la surveillance du FBI, voit la mémoire lui revenir. Tandis que Jane et Weller suivent une piste prometteuse, Shepherd prend le contrôle du bureau de New York. Son plan : accéder à l'ordinateur de Patterson pour lancer une série d'attentats...

Weller parvient à s'échapper du bunker. De son côté, Patterson cherche d'où viennent les explosifs posés par Shepherd. Une piste l'entraîne sur les traces de Zach Riley, aussitôt soumis à un interrogatoire. Sous la pression, celui-ci révèle que Shepherd a l'intention de faire sauter Washington...