Se sentant toujours responsable de la mort d'Eddie, Barry décide de protéger la ville tout seul. Mais lorsque Atom Smasher, doté d'une force herculéenne, attaque la ville, Iris supplie Barry d'accepter son aide et celle de ses amis. Pendant ce temps, Cisco tente d'aider Joe pour capturer les méta-humains...

Jay Garrick, un homme venant de Earth 2, débarque à Central City pour prévenir que Zoom, un méta-humain très puissant, a prévu de détruire Flash. Barry et l'équipe ne savent pas s'ils peuvent faire confiance au nouveau venu. Pendant ce temps, Joe a affaire à Patty Spivot, un agent qui souhiate rejoindre l'équipe...

Lisa Snart, alias Golden Glider, vient trouver l'équipe du Star Lab : son frère Lenny, le Captain Cold, a été kidnappé. Barry découvre que Lenny est forcé de faire équipe avec son père pour commettre un crime, sous peine de perdre sa sœur. Barry décide alors d'infiltrer le tandem pour faire échouer le projet...

Chez Star Labs, Cisco et Caitlin tentent toujours de trouver comment sauver la vie du professeur Stein grâce au stabilisateur du docteur Wells. Ils contactent deux métahumains pour tester leur compatibilité : un scientifique, Henry Hewitt, et un ancien espoir du football américain, Jefferson Jax Jackson...

Après avoir secouru Barry de King Shark, le docteur Wells de la Terre Deux livre le récit de sa traversée et fait part d'une menace pour Flash. Sur les conseils de Cisco, Barry se décide à inviter Patty à dîner. Ce dernier a une vision d'un braquage de la banque de Central City par une métahumaine de Terre Deux, le docteur Light. Barry décide ausitôt de la retrouver pour l'empêcher de nuire...

Flash tente une alliance inattendue dans sa lutte contre Zoom tandis que l'équipe de S.T.A.R. Labs cherche comment l'affronter. Patty et Barry se rapprochent.

Grodd retourne à Central City et kidnappe Caitlin. Barry et ses amis s'engagent dans une course contre la montre pour la retrouver. Pendant ce temps, Cisco prépare son premier rendez-vous avec Kendra Saunders. Patty commence à suspecter Barry de ne pas tout lui dire sur ses projets...

Vandal Savage arrive à Central City et s'en prend à Kendra et Cisco. Barry emmène Kendra à Starling City afin qu'elle soit protégée par Oliver et son équipe. Pendant ce temps, Harrison met au point un sérum pour augmenter la rapidité de Barry...

Mark Mardon réapparaît et libère Leonard Snart et Jesse James d'Iron Heights. Flash doit les arrêter avant qu'ils prennent le contrôle de Central City. Lorsque Patty apprend que Mark Mardon est de retour en ville, elle tente de venger la mort de son père. Harrison Wells accepte la proposition de Zoom. Pendant ce temps, Joe et Iris rencontrent Wally West...

Barry envisage d'avouer à Patty qu'il est Flash. Pendant ce temps, Joe et Iris cherchent à en savoir plus sur Wally, tout en pourchassant un méta-humain capable de ralentir le temps...

Cisco a réussi à obtenir de précieuses indications concernant Eobard Thawne. Barry et son équipe ne parviennent pas à y croire. Pourtant, lorsque les laboratoires Mercury sont attaqués, Christina McGee confirme qu'une autre version de Flash est bien de retour. Iris se rapproche de son frère, Wally...

Iris craint de plus en plus pour la vie de Wally, qui continue à participer aux courses de rue malgré la mort de sa mère. Elle décide d'effectuer des recherches sur l'organisateur. Barry, lui, souhaite s'attaquer au problème de brèches en collaborant avec Wells. Mais celui-ci lui préfère travailler seul...

Flash et son équipe referment les brèches reliant les deux Terre, à l'exception d'une car ils veulent sauver Jesse. Sur Terre-1, Caitlin, Jay et le détective West se battent contre un nouveau méta-humain. Barry et Cisco accompagnent Harrison Wells sur Terre-2 Ils y découvrent leur double…

Barry et Jesse sont avec un mystérieux prisonnier, retenu lui aussi par Zoom. Cisco et Harrison Wells, aidés des doubles, essaient de les sauver, tandis que Zoom les recherche. Sur Terre-1, Caitlin améliore à nouveau le Velocity pour aider Jay. Iris doit faire face à l'arrivée d'un nouveau rédacteur en chef chez Central City Picture News...

Diggle et Lyla se rendent à Central City : King Shark, bien décidé à tuer Flash, a en effet réussi à s'évader. Layla et Diggle préviennent Flash. King Sharp arrive chez les West et attaque Joe, Iris, Wally et Barry. Parallèlement, Barry, Cisco et Harrison décident de garder secret ce qui s'est passé sur Terre-2...

Barry essaie de repousser ses limites en sautant d'une falaise à une autre. Pour se remettre de leur semaine de travail, l'équipe sort danser dans un club. Elle y rencontre un métahumain, un voleur plus rapide que Flash. Scott Evans, le rédacteur en chef d'Iris, propage la rumeur : Flash serait devenu un voyou...

Barry a découvert que Zoom est en réalité Jay Garrick. Plus déterminé que jamais à l'arrêter, il décide de remonter le temps pour s'entretenir avec l'ancien Wells, alias Thawne. Seul lui est capable de lui enseigner comment devenir plus rapide. Mais le voyage vers Terre-2 est risqué...

Enfant, Barry a été recueilli par Joe suite au meurtre de sa mère, alors que Jay Garrick a vu son père assassiner sa mère et a été placé dans un orphelinat. Aujourd'hui, Flash est plus rapide que Zoom, et veut à tout prix le vaincre. Le seul moyen de retourner sur Terre-2 est d'utiliser les vibes de Cisco...

Caitlin, emprisonnée par l'amour de Jay, rencontre Killer Frost et le mystérieux prisonnier sur Terre-2. Wells a fini par retrouver sa fille, Jesse, afin de la protéger de Zoom, qui peut voyager d'une Terre à l'autre. Mais elle refuse de le voir et Wells est capturé par un nouveau métahumain, Griffin Grey...

Zoom arrive sur Terre-1 pour prendre Central City. Barry et Wells mettent au point un plan ingénieux afin de le stopper. Ils sont prêts à prendre tous les risques. Henry s'oppose à ce que Barry soit à nouveau exposé, mais Joe estime qu'il est tout à fait capable de réussir la mission qu'il a programmée...

Suite à l'explosion de l'accélérateur de particules, Jesse est tombé dans le coma et Barry a disparu. Mais Cisco a une vision de Barry en vie. Celui-ci est effectivement en train de lutter pour revenir. La détonation a eu un autre effet : à la morgue de Star Labs, un défunt métahumain a été transformé en zombie...

Zoom a laissé Caitlin rejoindre ses amis et rallié à sa cause de nombreux métahumains de Terre-2 pour terroriser Central City. Wally parcourt les rues pour aider Flash à les arrêter. Celui-ci pense être invincible jusqu'à ce qu'il soit confronté au double de Black Canary, qui détruit littéralement la ville. Cisco a des visions d'oiseaux morts. Quelle peut bien en être la raison ?...

Après l'assassinat de son père, Flash est défié par Zoom, qui menace de s'en prendre à nouveau à ses proches s'il refuse de faire une course de vitesse. Mais les membres de l'équipe, jugeant qu'il devient dangereux et incontrôlable, décident de l'enfermer et de combattre Zoom tout seuls...