Quatre ans ont passé. Toute l'équipe de Tree Hill a quitté l'université pour prendre des directions différentes. Lucas a publié un livre, Brooke a percé dans la mode et Peyton poursuit une carrière musicale. Nathan s'enfonce dans l'alcool, tandis que Haley s'apprête à enseigner dans leur ancien lycée...

Tous les anciens élèves du lycée de Tree Hill sont de retour en ville. Brooke et Peyton font la connaissance de Lindsey, la nouvelle petite amie de Lucas. Les jeunes femmes sont mal à l'aise : Lindsey a travaillé sur le premier livre de Lucas, qui portait sur son amour pour Peyton. Skills inscrit Jamie à une compétition de caisses à savon...

Lindsey, la petite amie de Lucas, a l'impression que Brooke et Peyton, récemment revenues à Tree Hill, menacent son couple. Nathan rend visite à Dan en prison sans en informer Lucas. Quant à Haley, elle essaie de convaincre Quentin, un élève turbulent, de revenir au lycée. Brooke ouvre sa boutique...

Après avoir critiqué sa fille qu'elle juge irresponsable, Victoria, la mère de Brooke, décide de l'aider à lancer son magasin de vêtements. Elles organisent une fête pour l'ouverture. Haley demande à Nathan de convaincre Quentin, le joueur le plus prometteur de l'équipe des Ravens, de reprendre les cours...

Victoria fait pression sur Brooke, qui doit prendre une décision cruciale pour l'avenir de sa collection de prêt-à-porter. Le coach Whitey a des doutes : Nathan a craqué avant un match de championnat. Haley a du mal à trouver le juste milieu entre son travail et sa vie de famille, et Nathan en pâtit...

Le climat est tendu à Tree Hill. Peyton s'est mal comportée envers Lindsey, et Lucas se retrouve entre les deux rivales. Quant à Brooke, elle souhaite parler à Victoria du label d'enregistrement de Peyton. D'autre part, Nathan se rapproche progressivement de Carrie tandis que Haley s'occupe toujours de Quentin...

Toute la bande passe la soirée au club Tric pour assister à un concert. Très vite, des tensions apparaissent. Lindsey en veut toujours à Peyton d'avoir dit qu'elle ne l'aimait pas et de se montrer un peu trop proche de Lucas. Haley et Peyton encouragent Mia, qui doit jouer en public pour la première fois...

Brooke est tombée sous le charme d'Owen, le nouveau barman. Haley en veut à Lucas d'avoir demandé Lindsey en mariage et d'avoir embrassé Peyton. Avant le match d'ouverture de la saison, Quentin doit absolument adopter une attitude plus positive. Alice, la patronne de Micro, est licenciée...

Le soir du premier match de championnat est arrivé. Micro cherche un angle intéressant pour son premier reportage. Alors que Peyton fait visiter le lycée à Mia, Haley et Brooke en font autant avec Lindsey. Les jeunes filles se retrouvent malencontreusement enfermées dans la bibliothèque de l'établissement...

Mia a l'occasion de signer un contrat avec un grand label. Pendant ce temps-là, le mariage de Nathan et Haley bat de l'aile, d'autant plus que Carrie fait tout son possible pour qu'ils se séparent définitivement. Brooke et Owen partent en voyage à New York, mais le séjour prend une tournure inattendue...

Lindsey et Lucas décident de profiter de leurs enterrements de vie de jeune fille et de garçon pour aider Haley et Nathan à se réconcilier. Dan semble vouloir reprendre contact avec son petit-fils. Milicent s'inquiète car Rachel, dont Micro a été amoureux il y a quelques années, est de retour à Tree Hill...

Le grand jour est arrivé pour Lucas et Lindsey. Nathan tente de se réconcilier avec Haley, mais en vain. Peyton voit sa dernière chance de trouver l'homme de sa vie s'envoler quand elle entend Lucas dire Je le veux. Dan, qui vient d'être libéré sur parole, fait une apparition surprise au mariage...

Lucas est anéanti. Lindsey l'a quitté devant l'autel. Haley et Nathan se rendent chez leur thérapeute. Celle-ci tente de leur expliquer qu'à leur âge, ils doivent se réaliser en tant qu'individus, et pas seulement en tant qu'époux ou parents. Brooke passe un entretien avec une assistante sociale...

Pour ne pas rester sur une mauvaise expérience, Nathan et Haley décident de rencontrer d'autres nourrices. Toujours déterminée, Brooke obtient une nouvelle chance de s'inscrire à l'agence qui s'occupe des adoptions. La relation de Micro et Millicent évolue. Peyton discute avec Lucas de son mariage avorté...

Nathan et Haley organisent une fête d'anniversaire surprise pour Jamie. Pour l'occasion, Lindsey revient à Tree Hill. Lucas ne peut pas s'empêcher d'espérer qu'ils vont renouer. Deb engage un clown, mais Haley a la phobie des clowns. Dan tente de retrouver sa place au sein de sa famille...

Lucas se pose des questions sur les problèmes cardiaques de son père et découvre qu'il disait la vérité. Il est alors partagé entre ses désirs et ses scrupules. Haley éprouve des difficultés à laisser Dan prendre de la place dans la vie de Jamie. Peyton se sent responsable de la séparation de Lucas...

Lucas reçoit des nouvelles accablantes de Lindsay. Lorsque son joueur fétiche est menacé de poursuites en justice par l'équipe adverse, sa frustration ne fait qu'augmenter. La petite Angie doit subir une opération du coeur. Sous l'emprise de l'alcool, Lucas fait une confession déchirante à Peyton...

Brooke prend la décision la plus difficile de sa vie : elle doit se séparer de la petite Angie, dont elle a pris soin avant et après son opération du coeur. Lucas, lui, doit faire face aux conséquences de la bagarre la nuit du match. La carrière musicale de Haley décolle enfin. Micro décide de déménager à Omaha...