Alors qu'Higgins est toujours à l'étranger avec Ethan, Magnum, qui tente de traiter ses affaire en solo, doit retrouver une cliente qui a disparu. La jeune femme est visiblement en danger, poursuivie par deux gangs extrêmement dangereux. Parallèlement, Rick reçoit de bonnes et de mauvaises nouvelles...

Higgins est obligée de s'éloigner d'Ethan car elle est la cible de criminels. C'est alors que le MI6 la contacte et lui demande de reprendre du service. Elle rentre à Hawaii et retrouve Magnum à qui elle doit cacher sa mission. Mais elle remarque très vite que Thomas lui dissimule quelque chose. Quant à Shammy et TC, ils sont kidnappés par deux faux touristes...

Un jeune caddie a été licencié après avoir été accusé du vol des clubs de golf d'un membre d'un country club huppé. Magnum, Higgins et Rick enquêtent afin de découvrir les raisons de ce licenciement. Jin, lui, est embarrassé car il est sollicité par sa nièce pour venir parler de son travail devant sa classe...

A la demande de sa thérapeute, Higgins, avec l'aide de Magnum, décide d'enquêter sur les raisons de la mort d'une jeune patiente qui s'est suicidée. Parallèlement, le fils de Katsumoto se retrouve à l'hôpital dans le coma après que lui et sa mère ont été victimes d'un carjacking...

Magnum et Higgins sont engagés à la veille de la noce par un fiancé anxieux qui veut se rassurer sur sa future épouse. Ils ne se doutent pas un instant que ce qu'ils croient être une simple peur du mariage va révéler une vie de mensonges et que cette affaire pourrait bien leur coûter la vie...

Magnum est engagé par un journaliste pour retrouver sa source anonyme qui n'a plus donné signe de vie depuis un moment. Pendant ce temps, Juliet reçoit un nouvel ordre de mission du MI6 et TC se renseigne sur un ancien ami de Rick, qui se trouve à Hawaï, et dont les motivations lui semblent suspectes...

Alors qu'un agent du FBI sollicite Rick pour arrêter son ami d'enfance récemment arrivé à Hawaii, Magnum démarre sa propre enquête pour savoir ce que l'agent fédéral a vraiment contre Robbie. Quant à Kumu, elle mène une investigation sous couverture dans une communauté de retraités...

Magnum prend Higgins en filature afin de découvrir ce qu'elle lui cache. Celle-ci a secrètement accepté d'infiltrer un groupe qui menace de faire tomber le MI6. Encore sous le choc d'une mort inattendue, Rick peine à faire son deuil et réalise qu'il est une cible potentielle...

La veille de Noël, le département de police d'Honolulu est victime d'une attaque de rançongiciels. Cela force Lia à révéler un lourd secret familial à Magnum et Katsumoto. Pendant ce temps, Cade est déçu que TC, Rick et Kumu lui aient acheté un camion d'occasion...

Une femme engage Magnum et Higgins pour retrouver un homme qu'elle a rencontré dans un café. Ils découvrent que ce dernier cache un terrible secret. Par ailleurs, Higgins est troublée par des rêves récurrents et cherche à en parler à son thérapeute...

Jin vend ses services de promeneur de chiens. Lorsque Higgins lui confie Zeus et Apollon, Jin leur donne du chocolat, ce que les deux chiens ne supportent pas. Une nonne engage Magnum et Higgins après qu'un paroissien a reçu un don anonyme pour payer son traitement médical...

T.C. essaie de convaincre Cade de retourner à l'école. Shammy demande à Magnum et Higgins de retrouver son ami, un vétéran sans-abri, qui a disparu. Les deux détectives découvrent que le malheureux a été tué dans un accident de la route avec délit de fuite. L'affaire serait liée à une escroquerie à l'assurance...

Lorsque la juge Rachel Park, nommée à la Cour Suprême d'Hawaï, est victime de chantage, elle engage Magnum et Higgins qui se donnent beaucoup de mal pour l'aider. De plus, avec la pression de la paternité imminente, Rick suggère des changements pour rendre La Mariana plus rentable...

Un agent de cautionnement qui, dans le passé, a été l'un des premiers clients de Magnum fait appel à lui pour retrouver une femme qui n'a pas payé sa caution de 250 000 dollars. De leur côté, TC et Katsumoto font équipe pour retrouver la mère de Cade, condition pour finaliser l'adoption...

A son insu, Magnum ingère un poison mortel qui fera effet dans les huit heures. Pour recevoir l'antidote, il doit retrouver le fils d'Osi Shima, un baron du crime. Tandis que Higgins se lance à la recherche d'un contrepoison, Magnum enquête. Il découvre que la victime a été enlevée par un proche de Shima.

La mère d'un poseur de bombe présumé engage l'équipe pour localiser son fils afin de le livrer aux autorités. Kumu et Rick aident T.C. à faire face à sa mauvaise conscience lorsqu'il retrouve Mahina, avec laquelle il avait eu une relation d'un soir avant de rompre tout contact...

Suzy est de retour, mais elle ne veut plus vivre avec Rick. De son côté, Magnum rend visite à Bob, un vétéran atteint d'une maladie en phase terminale. Le détective est par ailleurs engagé par Ella, une jeune fille qui lui demande d'enquêter sur un triple homicide sur lequel sa mère investiguait...

Magnum organise un service commémoratif militaire pour Bob. Higgins sympathise avec Cole, le père d'Ella. Le corps de Bruce Fletcher est découvert dans une tombe peu profonde creusée dans une forêt. La police soupçonne Sebastian Nuzo, l'ex-coéquipier de Magnum aujourd'hui décédé, d'être l'auteur de ce meurtre.

Greg, un homme désemparé, engage Magnum et Higgins pour enquêter sur un meurtre dont il pourrait être l'auteur mais dont il n'a gardé aucun souvenir. Il s'est en effet réveillé sur une plage, amnésique et couvert de sang. TC est décontenancé lorsque la grand-mère biologique de Cabe débarque sans prévenir.

Beth, l'ex-épouse de Gordon, est enlevée. En échange de sa libération, ses kidnappeurs exigent que Gordon assassine Whelan, son ex-coéquipier aujourd'hui emprisonné. Magnum et Higgins aident le policier à faire évader Whelan. Ils découvrent ensuite l'identité du maître-chanteur, Ray Nasano...