Les vacances auraient dû apaiser les angoisses des quatre filles. Mais elles n'ont fait que les dissimuler pour un moment. Chacune a pourtant essayé d'occuper son été de façon à oublier les événements tragiques qui ont agité l'année. Aria s'est essayée à la photographie et Spencer a pris des cours à Hollis...

En plein cours, Emily fait une découverte inquiétante en ouvrant son sac. Elle y trouve un collier dont les pierres ont été remplacées par une dent. Sidérée, elle décide de le jeter dans les toilettes. Ce cadeau empoisonné, les Pretty Little Liars en sont sûres, est de très mauvais augure...

En apprenant que sa mère a choisi de prendre la défense de Garrett, Spencer entre dans une colère noire. La jeune femme se demande ce qui a bien pu pousser Veronica à accepter la requête de l'officier de police. Emily, elle, s'inquiète après avoir découvert qu'Ella a terminé son propre examen d'anglais...

Décidées à découvrir le secret que cache Melissa, les Pretty Little Liars partent pour Philadelphie. Un peu plus tard, lors d'une dispute avec Caleb, Hanna reçoit un message inquiétant de A. Il s'agit d'une photo sordide, montrant un accident de voiture. De son côté, Jason DiLaurentis revient à Rosewood...

Jenna donne une fête pour célébrer tout à la fois son anniversaire et la disparition de son angoisse de devenir aveugle. A cette occasion, Paige boit une gorgée dans la flasque d'Emily. Peu après, son comportement devient inquiétant. Ses débordements culminent dans un affrontement avec Jenna...

Il semble que Garrett et A échangent des messages via sa mère malade. Les filles interceptent l'un de ces messages et sont convaincues qu'elles en apprendront davantage si elles mettent l'église de Rosewood sous surveillance. Mais, à l'heure dite, au lieu de A, c'est l'inspecteur Wilden qui se présente...

L'inspecteur Wilden veut analyser le sang d'Hanna, pour voir s'il présente des similitudes avec le sang qui a été retrouvé sur le bracelet d'Alison. Hanna en conclut que leur mystérieuse persécutrice tente de lui faire endosser ce meurtre. Aria, Emily et Spencer croient avoir aperçu Alison...

Les filles s'emploient ensemble à craquer le mot de passe du site web de Maya mais, en dépit de l'aide d'Emily, n'y parviennent pas. Spencer appelle Caleb à la rescousse. Pendant ce temps, Aria fait la connaissance de la mère d'Ezra, une femme fort riche, qui l'invite à un gala de charité...

Spencer a laissé passer la date limite d'inscription à l'université où elle rêve d'entrer, trop préoccupée par les rebondissements incessants de l'affaire A. CeCe lui apprend qu'elle connaît l'un des responsables du bureau des admissions et qu'il sera justement présent lors d'une fête où elle se rend...

Hanna découvre un billet abandonné par Maya. Elle finit par comprendre que Maya a laissé ce papier la nuit où elle a été assassinée. De plus amples investigations la persuadent également que l'une des photos piratées sur le site web de la disparue a été prise dans la cabane de Noel Kahn...

Spencer est estomaquée quand elle apprend qu'Alison et Paige se connaissaient et qu'en outre Alison prenait un malin plaisir à tourmenter Paige. Elle s'interrompt là dans ses réflexions quand elle se retrouve enfermée dans une pièce close avec un serpent venimeux. CeCe la tire de ce mauvais pas...

Alors que le procès de Garrett va s'engager, rien ne va plus entre les amies. Emily est furieuse depuis qu'elle sait qu'Aria, Hanna et Spencer soupçonnent Paige et A de ne faire qu'une. Scandalisée, elle accepte une virée en dehors de la ville avec Nate pour prendre de la distance avec tout ce pataquès...

Pendant que Mona reçoit la visite de Toby, les filles montent à bord du train fantôme. Aux éclats de rire succèdent pour Spencer une plongée dans l'angoisse quand Garrett lui murmure de troublants secrets au sujet d'Alison. Pour sa part, Caleb fait à Hanna une surprise dont elle se serait bien passée...

Mona est de retour au lycée de Rosewood. Les discussions vont bon train à ce sujet. Spencer demande à Aria d'interroger Byron à propos du décès de Garrett.

Les filles découvrent que les affaires de Harold ont disparu. Aria, de son côté, commence à douter sérieusement de l'innocence de Byron : elle est en colère.

Spencer demande des comptes à Toby lorsqu'il apprend la vérité à son sujet. Meredith administre de la drogue à Aria pour pouvoir lire le journal d'Ali.

Hanna est sûre que Caleb lui cache quelque chose et est déterminée à en savoir plus. Spencer en a assez de cette ambiance et ne veut plus jouer le jeu.

Maintenant que le corps d'Ali a été récupéré par sa famille, les DiLaurentis décident de procéder à de nouvelles funérailles. C'est l'occasion pour Aria, Emily, Hanna et Spencer de faire leurs adieux. Mais Spencer hésite : après tout, elle ne se sent pas si proche d'Ali...

Spencer a été radiée de l'équipe académique de décathlon. Elle décide de défier Andrew au strip trivia dans l'espoir de réintégrer le groupe, mais sans succès.

Hanna révèle à sa mère que Alison et Wilden ont entamé une liaison. Parallèlement, Ezra est de retour à Rosewood : il compte bien récupérer Aria.

Spencer avoue à ses amies que Toby a retourné sa veste et qu'il est passé dans le camp de Mona. Pendant ce temps, Aria joue les baby-sitters avec le fils d'Ezra.

Spencer s'est réfugiée à l'Institut Radley. Pendant ce temps, Aria tente de persuader Byron d'aider Ezra à décrocher un poste d'enseignant.

Les filles essayent de convaincre Spencer que le corps qu'elle a vu dans les bois n'était pas celui de Toby : malheureusement, Spencer doute.

Mona internée, les filles pensaient que leurs ennuis s'arrêteraient : malheureusement pour elles, il n'en est finalement rien.