X-Files

Scully recherche Mulder, qui a mystérieusement disparu. John Doggett, un nouveau coéquipier, se joint à elle pour l'assister dans son enquête.

Scully part seule à la recherche de Mulder : elle ne croit pas à sa mort et refuse de faire confiance à qui que ce soit pour mener ses investigations.

Scully et son nouveau coéquipier, Doggett, sont envoyés dans l'Idaho pour enquêter sur un meurtre étrange : on a retrouvé les corps saignés à blanc d'un homme et d'une femme. Les plaies laissent à penser qu'ils ont été mordus par une créature mystérieuse, que Scully s'entête à croire humaine...

Une petite bourgade de l'Utah, perdue dans le désert. Un jeune homme a été battu à mort à sa descente du bus par un groupe d'individus. Scully est envoyée sur place et procède à l'autopsie du cadavre. Elle découvre que la colonne vertébrale du garçon est celle d'un vieillard presque centenaire...

Dans l'Oklahoma, Billy Underwood, un enfant, s'amuse aux côtés de sa mère, Lisa. Il ne remarque pas qu'un jeune homme brun le suit du regard. Lorsque sa mère se retourne, Billy a disparu. Dix ans plus tard, elle le retrouve. Il n'a absolument pas changé : il semble toujours avoir 10 ans...

Martin Wells est emprisonné, accusé d'avoir tué sa femme. Pour se venger, son beau-père l'assassine. A partir de cet instant, le temps remonte son cours. L'histoire reprend à la prison où Martin est incarcéré. Il ne sait pas ce qu'il fait là et raconte ses souvenirs à Scully, sceptique...

Après le massacre de la secte de Waco, au Texas, le FBI est sur le qui-vive. Deux agents ont été chargés de surveiller les faits et gestes d'une organisation religieuse particulièrement louche. Ils décident de pénétrer dans la maison qui abrite ses membres, mais il est déjà trop tard...

Alors que Carlton Chase essaie de joindre un correspondant à partir d'une cabine téléphonique, une ombre se dresse devant lui. Pour tenter de lui échapper, l'homme se réfugie dans un commissariat et devient hystérique. Les officiers de police l'enferment dans une cellule. Soudain, sa tête explose...

Ray Pearce est mort des suites d'une étrange maladie. Il n'était âgé que de 41 ans et sa femme, Nora, est persuadée qu'il a été victime du syndrome de la guerre du Golfe. Elle se confie à un ami, qui ne l'a pas plus tôt quittée qu'il tombe sur le prétendu mort, apparemment en pleine santé...

Un Américain de retour d'Inde meurt dans sa chambre à Washington, les yeux injectés de sang. Scully et Doggett découvrent une minuscule empreinte de doigt, et font le rapprochement avec un cas similaire dans le Maryland. L'autopsie révèle que Potocki est mort avant même d'arriver aux États-Unis…

Doggett s'intéresse à ce que faisait Mulder juste avant qu'il ne disparaisse. Il semblerait qu'il enquêtait sur un dossier ultra-secret dont il n'aurait pas parlé à Scully. Doggett finit par se convaincre que Mulder cherchait en fait un remède à sa maladie. Une hypothèse qui reste à démontrer...

Le cadavre d'un homme couvert de brûlures est retrouvé dans un couloir du métro de Boston. Doggett et Scully se rendent compte qu'ils ont sans doute affaire, non pas à un tueur en série comme ils le craignaient, mais à quelque créature maléfique qui aurait élu domicile dans les entrailles urbaines...

L'enquête de Doggett et Scully porte sur les inséminations extraterrestres pratiquées sur des femmes au cours de kidnappings de grande envergure. Scully est immédiatement renvoyée à sa propre situation et à l'origine mystérieuse de l'enfant qu'elle porte. Elle se demande si elle doit se confier à Doggett...

L'enquête sur la disparition de Mulder rebondit le jour où l'on retrouve Teresa Hoese, enlevée le même jour que le coéquipier de Scully. Teresa est vivante, mais d'affreuses blessures rituelles couvrent son corps. Doggett fait alors appel à Monica Reyes, un agent spécialisé dans les rites sataniques...

Scully ne se console pas de la mort de son partenaire Mulder, décédé il y a trois mois. La découverte d'un extraterrestre, qui montre une étonnante résistance, lui rend l'espoir. Elle voudrait utiliser ses capacités pour rendre la vie à Mulder. Mais pour l'instant, elle doit gérer l'éviction de Doggett...

Un homme force l’entrée de la Maison Blanche pour avertir ...

Monica Reyes est appelée par la police de la Nouvelle-Orléans pour enquêter sur des meurtres avec rituels sataniques. Elle demande à Mulder de l'aider pour une raison particulière : cette affaire semble liée à la mort du fils de Doggett, qui n'a jamais été élucidée. Scully, dont la grossesse arrive à terme, est transférée à l'hôpital...

Scully autopsie le corps d'un employé d'une plate-forme pétrolière. Elle s'aperçoit qu'il a été infecté par de l'huile noire, une substance qui pourrait avoir été amenée par une civilisation extraterrestre. Pendant ce temps, un autre ouvrier capte des émissions inhabituelles sur la radio du site pétrolier...

Scully est en congé maternité et Mulder a été démis de ses fonctions au sein des affaires non-classées. Doggett se voit attribuer une nouvelle partenaire, l'agent Leyla Harrison, fascinée par les affaires non-classées et la carrière de Mulder et Scully. Doggett et Harrison enquêtent sur un meurtre dont l'auteur pourrait ne pas être humain.

L'enfant de Scully se révèle parfait et surprend tous les scientifiques qui se penchent sur son cas : il semble que le bébé concrétise tous leurs rêves.

Alors qu'un médecin pratique une autopsie, il découvre une vertèbre métallique aux propriétés stupéfiantes. Durant la nuit, le corps disparaît.