Shikamaru awansuje na chunina. On i jego towarzysze z drużyny świętują to wydarzenie w restauracji BBQ. Lee decyduje się poddać niebezpiecznej operacji, by pozbyć się defektów i móc pozostać ninja.

Naruto i Sasuke stają do walki gotowi użyć swoich najpotężniejszych technik ataku. W samą porę pojawia się Kakashi, by przerwać starcie. Sasuke dostrzega postępy Naruto i pała gniewem oraz rosnącą chęcią zemsty na swoim bracie, Itachi.

Przed Sasuke nagle pojawiają się Czterej Ninja Dźwięku: Kidomaru, Sakon, Jirobo i Tayuya. Sakura martwi się o Znak Klątwy, który Orochimaru nałożył na Sasuke, ale Naruto próbuje ją uspokoić, przekonując, że Sasuke nigdy nie sprzymierzy się z Orochimaru. Jednak złożona przez niego oferta zdobycia ogromnej mocy jest dla Sasuke zbyt kusząca, by mógł ją odrzucić.

Prośby Sakury pozostają bez odpowiedzi, a Sasuke opuszcza Wioskę Ukrytego Liścia. Kiedy Tsunade dowiaduje się o tym wzywa Shikamaru, aby poprowadził jego pierwszą misję jako chunina. Shikamaru zbiera swoją drużynę złożoną z Naruto, Chojiego, Nejiego, Kiby oraz Akamaru i wyrusza na poszukiwanie Sasuke.

Czterej Ninja Dźwięku wraz z Sasuke pędzą w kierunku kryjówki Orochimaru. Zostają namierzeni i wyzwani na pojedynek przez joninów Genmę i Raido, ale ninja Liścia są już zmęczeni i padają. Tymczasem oddział ratunkowy Shikamaru ostrożnie podąża za klanem Dźwięku.

Naruto i jego towarzysze zostają uwięzieni w ziemnej kopule Jirobo. Próbują się stamtąd wydostać, ale bezskutecznie. Piątka powoli traci siły, gdyż przeciwnik wysysa ich czakrę. Shikamaru podejmuje ryzykowną grę i proponuje, by wypuszczono tylko jego. Na pierwszy rzut oka zdradza drużynę, lecz w rzeczywistości realizuje przemyślany plan.

Po wydostaniu się z ziemnej kopuły Shikamaru wraz z drużyną rusza w pogoń za pozostałymi członkami klanu Dźwięku, zostawiając Chojiego. Ten wyjmuje trzy tajemnicze pigułki swojego klanu i połyka pierwszą z nich, zieloną, aby zwiększyć swoją moc. Samotnie staje do walki z potężnym przeciwnikiem.

Po zażyciu żółtej pigułki Choji zaczyna mieć przewagę i wydaje się, że może wygrać walkę. Jirobo przechodzi jednak w Drugi Stan, zyskując w ten sposób ogromną moc. Choji zostaje przyparty do muru. Ma jeszcze jedną możliwość - czerwoną pigułkę, która daje ogromną moc, ale jej użycie jest śmiertelnie niebezpieczne.

Przekonani, że drużyna Liścia nie zdoła pokonać Jirobo pozostali ninja Dźwięku rezygnują z zastawiania pułapek. Shikamaru wykorzystuje tę sytuację - przebiera się za Jirobo i szybko ich dogania. Przeciwnicy natychmiast rozpoznają podstęp, a Shikamaru zaplątuje się w sieć Kidomaru.

Neji staje do walki z Kidomaru, podczas gdy reszta drużyny kontynuuje pościg za Sasuke i pozostałymi ninja z klanu Dźwięku. Neji wykorzystuje swoją technikę Łagodnej Pięści, a Kidomaru dochodzi do wniosku, że lepiej będzie atakować z dystansu i szukać słabego punktu Nejiego.

Kidomaru zmienia taktykę i tworzy łuk oraz strzały, by zaatakować martwy punkt Nejiego. Gdy uda mu się precyzyjnie go namierzyć, Neji może stracić wszelkie możliwości obrony. Jedyną szansą pozostaje odbicie ataku i skierowanie go z powrotem na napastnika.

Naruto, Shikamaru, Kiba i Akamaru ścigają Sasuke i ninja z klanu Dźwięku. Naruto i Kiba są rozgoryczeni, że nie udało im się ich dogonić i postanawiają przeprowadzić nocny atak z zaskoczenia. Tymczasem Orochimaru, wyczerpany i bliski śmierci, z niecierpliwością wyczekuje nowego ciała. Czas nagli, a ninja z klanu Dźwięku mogą nie zdążyć dostarczyć Sasuke na czas.

Akamaru podkłada ładunki wybuchowe na drzewach, by zastawić pułapkę na Sakona. Rozwścieczony Sakon odwraca jednak sytuację, a eksplozje sprawiają, że wraz z Kibą i Akamaru spadają z klifu. Tymczasem Tayuya nieustannie zbliża się do drużyny Naruto. Ten zaś przygotowuje się do walki, lecz nagle za jego plecami pojawia się nowe zagrożenie - Kimimaro.

Shikamaru jest zdeterminowany, by powstrzymać Tayuyę, ale ona wykorzystuje swoją Technikę Przywołania, by sprowadzić trzech gigantów. Tymczasem na równinie wkrótce rozpocznie się walka między Kimimaro a Naruto. Gdy Kiba i Akamaru walczą razem na dnie wąwozu, pojawia się nowy przeciwnik. Z wnętrza ciała Sakona wyłania się jego brat, Ukon.

Ukon, który potrafi przenikać do ciał innych osób, wnika w Kibę i próbuje połączyć się z jego komórkami. Tymczasem Naruto jest zszokowany potęgą Kekkai Genkai Kimimaro, a Shikamaru toczy desperacką walkę z Tayuyą i jej gigantycznymi bestiami.

Ranni Kiba i Akamaru ledwo uciekają przed Sakonem i Ukonem. Naruto toczy walkę z Kimimaro, a Shikamaru ma poważne kłopoty z trzema gigantami Tayuyi. Wykorzystuje ostatnie pozostałe mu pieczęcie wybuchowe, by się wydostać, po czym ukrywa się, by zaplanować swój ostatni ruch

Shikamaru udaje się uwięzić Tayuyę za pomocą Techniki Imitacji Cienia. Tayuya przechodzi jednak w swój Drugi Stan i kontratakuje z ogromną siłą. Tymczasem Kiba opiekuje się Akamaru i opatruje własne rany, podczas gdy zbliżają się trzy nowe cienie. Naruto, mimo użycia licznych Klonów Cienia, nie jest w stanie pokonać Kimimaro. Niespodziewanie z chmury dymu wyłania się Sasuke.

Gdy Rock Lee staje do walki z Kimimaro, Naruto może ruszyć w pościg za Sasuke, który się przebudził. Lee atakuje z ogromną agresją, a Kimimaro zostaje odepchnięty przez jego potężne taijutsu.

Shikamaru, Kiba i Lee są już na skraju wyczerpania, gdy pojawiają się Gaara, Temari i Kankuro, by wesprzeć swoich sojuszników. Gaara rzuca się na Kimimaro, wykorzystując swój piasek, a Temari wkracza do akcji, by powstrzymać Tayuyę. Kiba, który wyczuł zbliżające się kroki, jest zaskoczony widokiem Kankuro. Dzięki potężnym sojusznikom rozpoczyna się nowa kontrofensywa.

Kimimaro zdaje sobie sprawę, że walka wręcz z piaskową ścianą Gaary jest niemożliwa, więc cofa się, by przeprowadzić atak z dystansu. Gaara nie przejmuje się jednak zdolnością Kimimaro do manipulowania własnymi kośćmi oraz wystrzeliwania ich z ciała i nadal wykorzystuje swój piasek zarówno do obrony, jak i ataku.

Kimimaro udaje się rozbić ochronną tarczę z piasku Gaary i atakuje go. Tymczasem Naruto w końcu dogania Sasuke, który pędzi ku swojemu przeznaczeniu w rękach Orochimaru.

Naruto Uzumaki, młody ninja, ciężko trenuje, zawiera przyjaźnie i stawia czoła wrogom, dążąc do spełnienia marzenia o zostaniu Hokage.

Znak Klątwy pokrywa połowę ciała Sasuke, a on sam nie jest już taki jak dawniej. Naruto rusza do ataku na nowego Sasuke, który odwrócił się od swoich najbliższych towarzyszy.

Naruto zostaje powalony przez technikę Wielkiej Kuli Ognia Sasuke. Jest ona przekazywana z pokolenia na pokolenie w rodzinie Uchiha, a opanowanie jej oznacza, że ninja stał się pełnoprawnym wojownikiem. Była to pierwsza technika, której ojciec nauczył Sasuke, gdy był jeszcze mały. Chłopiec cieszył się, że zwrócił na siebie jego uwagę i ciężko trenował, by ją opanować i zasłużyć na jego uznanie.

Sasuke uważnie obserwuje, jak Naruto zanurza się coraz głębiej w wodzie. Przypomina sobie o wydarzeniach z przeszłości, kiedy klan Uchiha został okrutnie wymordowany. Jego przyjaciele i rodzice zginęli z rąk Itachiego, który opanował niemal nie do powstrzymania Mangekyo Sharingan.

Kakashi wykorzystuje swoją technikę przywoływania i wysyła psy ninja, by wytropiły Naruto i Sasuke. Dzięki nowo zdobytej mocy Sasuke jest zdeterminowany, aby pokonać Naruto. Kierują nim słowa Itachiego, który stwierdził, że zwycięstwo nad przyjacielem pozwoli mu uzyskać Mangekyo Sharingan.

Naruto uwalnia Czakrę Dziewięcioogoniastego i odrzuca Sasuke potężnym uderzeniem. Ten odpowiada mu techniką Stylu Ognia, lecz Naruto bez trudu gasi płomienie. Sasuke zarzuca Naruto, który nie ma rodziny, że nie rozumie jego uczuć. Naruto jednak traktuje go niemal jak brata i wspomina chwile, w których ich drogi przecięły się w przeszłości.

Wydaje się, że Czakra Dziewięcioogoniastego Naruto porusza się wedle własnej woli, odpierając potężne ataki Sasuke. Wkrótce ciało Sasuke również ulega przemianie. Przełamując dojmujący ból czuje on, że czas dobiegł końca.

Zacięta walka z Sasuke kończy się utratą przytomności przez Naruto. W końcu u jego boku zjawia się Kakashi. Oddział medyczny ma pełne ręce roboty, opatrując wszystkich rannych członków drużyny. Choć straty są czymś, czego należało się spodziewać, Shikamaru bardzo przeżywa porażkę misji. Niespodziewanie Naruto odzyskuje siły.