Après s'être exprimé dans la presse, Hondo décide de prendre du recul. Il se retire dans une ville tranquille du Mexique pour faire un point sur sa vie et son avenir professionnel. Bien malgré lui, il se retrouve rapidement mêlé à la lutte d'une mère et sa fille qui se battent pour ne pas perdre leur ferme, convoitée par les Novak, une famille mafieuse locale.

Hondo, toujours au Mexique, fait équipe avec un policier local pour une mission de sauvetage qui pourrait s'avérer risquée. Delfina a en effet été kidnappée par les Novak, qui veulent ainsi faire pression sur sa famille Hondo découvre rapidement qu'il est personnellement pris pour cible. De retour à Los Angeles, Hicks envisage de dissoudre définitivement l'équipe.

Des cambrioleurs braquent une bibliothèque emblématique de Los Angeles. L'équipe découvre alors que des plans architecturaux importants ont été volés, ce qui pourrait menacer la sécurité de la ville. L'équipe est également surprise par l'arrivée d'un nouveau chef, Rogrigo Sanchez. Celui-ci peine à se faire accepté, et l'ambiance est plombée par la suspicion quant à ses motivations.

L'équipe du S.W.A.T. tente d'arrêter une bande de voleurs armés et violents. Mais leurs recherches sont freinées par des civils qui utilisent une application de sécurité publique qui encourage l'auto-justice. De son côté, Street apprend une terrible nouvelle. Hondo a découvert que Sanchez avait été chargé de le pousser à la démission. Leur rivalité devient un vrai problème sur le terrain.

Après avoir répondu à un appel pour violation de domicile, l'équipe met au jour un complot meurtrier contre un ancien joueur de football américain. Hicks, de son côté, a enfin découvert une piste concernant une affaire de Jane Doe sur laquelle il a travaillé vingt ans plus tôt...

Le plateau d'une émission d'information controversée qui fait la promotion de théories conspirationnistes est prise d'assaut par des hommes armés. Sur place, l'équipe va tout mettre en oeuvre pour empêcher la prise d'otages de dégénérer, surtout qu'il s'agit d'une émission en direct. De son côté, Chris soutient Street alors qu'il se prépare pour les funérailles de sa mère...

Hondo et son équipe doivent retrouver deux jeunes Caribéens en fuite après une fusillade avec d'anciens membres des forces spéciales russes, menés par un homme mystérieux surnommé le baron. Tous les membres du S.W.A.T. rivalisent d'ingéniosité pour faire des farces à Chris pour son anniversaire, mais Street a un cadeau spécial pour elle...

Dans un débit de boisson, une jeune femme sans papiers est enlevée par un gang ultra-violent venant du Honduras. L'équipe du S.W.A.T. doit la retrouver avant qu'elle ne soit contrainte de quitter le pays. La confiance suscitée par Luca permet d'identifier la victime. Par ailleurs, Hondo décide de présenter Nichelle à sa mère. Celle-ci lui demande sans détour si elle souhaite avoir des enfants...

Deacon est chargé par sa société de sécurité privée d'escorter un client jusqu'à Las Vegas. Chris accepte de le seconder. Sur le trajet, le client demande à faire un petit détour par un village fantôme ayant servi de décor à de nombreux westerns. Mais sur la route, ils sont pris en embuscade...

Le S.W.A.T. fait équipe avec la DEA pour retrouver des lance-roquettes. Ces armes, introduites en contrebande, sont dotées d'une technologie capable de pénétrer des chars blindés. Tan doit faire face à un problème personnel lorsqu'un collègue est blessé. Luca pense que la mère de Kelly veut le séduire...

Un pirate s'est introduit dans les ordinateurs de la police de Los Angeles. Le S.W.A.T. doit le localiser au plus vite avant qu'il ne révèle l'identité de tous les agents travaillant sous couverture, les mettant ainsi en danger. De plus, Street doit faire face à ses erreurs passées...

Des voleurs armés font irruption dans une maison de ventes aux enchères du centre-ville. Le S.W.A.T. est aussitôt mis sur l'affaire. Mais pour Hondo, l'affaire prend un tour personnel puisque sa soeur, Winnie, travaille là-bas. Elle a été prise en otage avec tous les autres employés de l'établissement.

Joey Baratta, un dangereux détenu, s'évade de prison et commet des meurtres à la voiture piégée pour le compte d'autres criminels, afin de laisser une somme confortable à sa famille. Michelle est sur le point de devenir mère mais, au dernier moment, la mère biologique renonce à faire adopter son enfant...

Le S.W.A.T. doit arrêter un groupe de dangereux criminels soupçonnés de vol. Cette opération oblige Tan à collaborer avec une personne de son passé qu'il aurait préféré ne jamais revoir. Par ailleurs, Luca est appelé à remplacer temporairement Hicks...

Lorsque des employés d'un hôpital de Los Angeles sont pris pour cible par un homme armé, l'équipe du S.W.A.T. se précipite sur les lieux. L'homme a fait plusieurs victimes dans la cafétéria de l'établissement. L'équipe apprend que le tireur est un homme désespéré dont le fils s'est vu refuser une greffe de rein...

Michelle découvre sur le site Internet de la chaîne d'information locale une vidéo dans laquelle Hondo abat de sang-froid deux policiers faisant l'objet de plaintes pour violences racistes. Hondo, se sachant victime d'une machination, décide de fuir la police afin d'éclaircir cette affaire lui-même...

Alors que les jeunes recrues sont en plein exercice, un site de forage explose, menaçant un immeuble d'habitation voisin. Powell se lance seule dans une mission de sauvetage, contre les ordres de l'équipe. Heureusement, la victime et elle s'en sortent indemnes, mais Hicks ne voit pas ce comportement d'un bon oeil...

Hicks assiste, impuissant, à l'assassinat d'un ami de longue date, un juge. L'équipe tente de retrouver le tueur au plus vite et de déterminer pour quelle raison le magistrat a été pris pour cible. Par ailleurs, Lucas ne sait pas comment aider son frère Terry après que celui-ci a été arrêté...

Street est envoyé à Miami où il est rejoint par le marshal Urbano avec qui il est chargé d'escorter Peter Galloway, un criminel endurci, jusqu'à Los Angeles. Mais peu de temps après le départ du vol, Galloway et deux de ses complices parviennent à prendre le contrôle de l'avion...

Lors d'une intervention, Street pénètre dans une maison dans laquelle il découvre de nombreuses armes. La demeure appartient à un trafiquant qui est appréhendé dès son retour chez lui. Pendant son interrogatoire, il révèle avoir vendu plusieurs armes à un homme qui compte s'en servir le jour même...

Un groupe d'hommes armés pénètre chez une famille dans le but de s'emparer de trois statuettes de grande valeur. Les voleurs torturent et massacrent tous les membres de la famille avant de quitter les lieux, à l'exception d'une fillette, Caitlin, cachée au milieu de ses jouets dans un placard. Hondo soupçonne le Saint de faire circuler une nouvelle drogue très dangereuse.

Un salarié récemment licencié parvient à pénétrer dans le laboratoire universitaire qui l'employait. Sous la menace d'une arme, il contraint les étudiants à fabriquer des bombes neurotoxiques. Après qu'il a réussi à prendre la fuite, le S.W.A.T intervient pour contrecarrer une attaque terroriste dévastatrice...