Après cinq mois passés à reconstruire les liens entre la Fédération et des mondes lointains, le capitaine Michael Burnham et l'équipage du Discovery sont chargés de porter secours à une station spatiale endommagée. Sur place, ils découvrent une nouvelle menace terrifiante : une anomalie gravitationnelle...

Saru revient pour tenter d'aider l'équipage du Discovery à découvrir le mystère de cette nouvelle force gravitationnelle exceptionnellement destructrice. Tout en dirigeant les opérations, Michael Burnham doit également trouver un moyen d'aider Booker à faire face à l'anéantissement de son monde natal...

Lors d'une attaque d'un vaisseau de Starfleet, un officier est tué. Une chasse à l'homme est alors lancée, à laquelle participent Burnham et Tilly. Pendant ce temps, Stamets et l'équipe scientifique mènent une course contre la montre pour empêcher que l'anomalie ne tue d'autres personnes...

Tilly et Adira dirigent une équipe de cadets de la Starfleet Academy lors d'une mission d'entraînement. Malheureusement, un accident provoque le crash du vaisseau sur une lune inhospitalière. Burnham participe à dans des négociations tendues pour la réintégration de Ni'Var dans la Fédération...

Burnham et Booker sont chargés d'évacuer un groupe de colons de Radvek V qui se trouve sur la trajectoire de l'anomalie. Ruon Tarka, l'un des plus brillants scientifiques de la Fédération, monte à bord du Discovery pour tenter d'identifier les créateurs de l'anomalie avec Saru et Stamets...

Après l'arrêt de l'expérience du docteur Tarka, jugée trop dangereuse, le Discovery est chargé de s'aventurer dans la faille subspatiale générée par l'anomalie afin de faire des scans approfondis. Mais la zone, totalement obscure, s'avère être un piège qui se referme sur le vaisseau et son équipage...

La présidente Rillak organise une assemblée réunissant des représentants de toute la galaxie afin de décider ensemble de ce qu'il convient de faire face à l'anomalie. Certains sont favorables à une réponse militaire, d'autres souhaiteraient tenter d'établir un contact avec les créateurs de cette menace...

Après la décision de l'assemblée, le docteur Tarka ne renonce pas à son projet. Avec l'aide de Booker, il a l'intention de construire l'arme susceptible de détruire l'anomalie. Il charge Booker de se procurer de l'isolynium, un composant essentiel. Mais Burnham va tout faire pour l'en empêcher...

Burnham et l'équipage du Discovery font tout leur possible pour empêcher Booker et le docteur Ruon Tarka de lancer un projet clandestin qui pourrait, par inadvertance, déclencher une guerre intergalactique. La civilisation à l'origine de l'anomalie étant très avancée, l'issue du conflit serait désastreuse...

Après la destruction de la première anomalie, ses créateurs en ont déployé une autre, encore plus puissante. Le capitaine Burnham et son équipage doivent alors se rendre là où peu de gens sont allés auparavant : au-delà de la barrière galactique. De son côté, Booker découvre les réelles motivations de Tarka...

Le capitaine Burnham mène une mission d'exploration sur une planète qui a jadis abrité les extraterrestres responsables de l'AMN. Le but est d'en apprendre plus sur les créateurs de l'anomalie afin de pouvoir communiquer avec eux. Booker et Tarka s'infiltrent à bord de l'USS Discovery, à l'insu de l'équipage...

L'AMN s'approche de la Terre et de Ni'Var. Burnham et l'équipage du Discovery, qui maîtrisent désormais les bases de la langue des créateurs de l'anomalie, tentent d'établir le contact avec eux. Le temps est compté. Booker découvre que le docteur Tarka a pris le commandeur Reno en otage...

L'AMN approche dangereusement de la Terre et de Ni'Var. Alors que les évacuations sont en cours, le capitaine Burnham et l'équipage du Discovery doivent trouver un moyen de communiquer avec cette espèce si différente de la leur avant qu'il ne soit trop tard. Ils doivent également arrêter Ruon Tarka...