La capitaine Burnham et l'équipage de l'U.S.S. Discovery sont envoyés pour récupérer un mystérieux artefact caché à l'intérieur d'un vaisseau romulien vieux de 800 ans. Quand ils découvrent qu'ils ont été pris de vitesse par deux individus peu recommandables. ils se lancent aussitôt à leur poursuite.

Pour la dernière mission de Saru en tant que numéro un du capitaine Burnham, avant de quitter ses fonctions pour devenir ambassadeur de la fédération, le Discovery et son équipage s'aventurent sur une planète apparemment abandonnée, à la recherche de ce qui pourrait être le plus grand trésor de la galaxie.

Sur Trill, Burnham, Book et Culber doivent réussir une épreuve pour être dignes de recevoir le prochain indice. Mais celui-ci est protégé par des créatures féroces. Pendant ce temps, Adira renoue avec Gray, et le premier jour de Saru en tant qu'ambassadeur est compliqué par ses fiançailles avec T'Rina.

En route vers le prochain indice, l'U.S.S. Discovery est saboté par Moll, qui y a placé un virus temporel, une arme datant de l'époque des Guerres temporelles. Dès l'arrivée du vaisseau aux coordonnées de l'indice, le virus s'active et piège l'équipage dans une série interminable de sauts dans le temps.

Burnham et Book se lancent à la poursuite de Moll et L'ak dans l'espace extradimensionnel, à la recherche du prochain indice. Ils tombent alors sur une version alternative de l'Enterprise, issue de l'univers miroir. Pendant ce temps, Rayner effectue sa première mission à la tête du Discovery.

Discovery découvre l'emplacement du prochain indice. Il s'agit d'une tour météorologique Denobulan située sur la planète Halem'no. Pour récupérer l'indice, qui est aux mains d'un peuple primitif, Burnham viole la Première Directive de la Fédération. Pendant ce temps, Moll et L'ak courent toujours.

Alors que Moll et L'ak sont enfin détenus, la Fédération se retrouve au cœur d'une tempête diplomatique et éthique lorsque les Breens arrivent et exigent qu'ils leur soient livrés.

Quand Burnham est piégée dans un "paysage mental" conçu pour tester sa capacité à récupérer la puissante technologie des Progéniteurs, Book, Rayner et l'équipage du Discovery doivent repousser les Breens assez longtemps pour qu'elle puisse s'échapper.

Après que Moll et les Breens se sont emparés d'une mystérieuse structure contenant le pouvoir des Progéniteurs, la capitaine Burnham doit mener une mission secrète pour la récupérer avant que les Breens ne découvrent comment l'utiliser. L'ennui, c'est que la confrontation se situe entre deux trous noirs.

Piégée à l'intérieur d'un mystérieux portail qui défie les règles habituelles du temps, de l'espace et de la gravité, Burnham doit combattre Moll, afin de localiser la technologie des Progéniteurs et de la mettre à la disposition de la Fédération. Elle essaie de convaincre Moll de collaborer avec elle.