Deux ans après le détournement du vol KA29, Sam Nelson se retrouve confronté à une nouvelle épreuve qui met sa vie en danger, mais cette fois-ci, c'est une affaire personnelle.

Sam pousse Otto à garder son sang-froid alors que les passagers commencent à se douter que quelque chose ne va pas. Winter, la préfète de police, s’empresse de réagir.

La police berlinoise s'efforce de maîtriser la situation. Sam fait pression sur Winter pour qu'elle accepte ses conditions. Marsha découvre qu'elle est surveillée.

Un événement inattendu oblige Sam à faire une bonne action. À Londres, Daniel fait appel à une amie pour l'aider à enquêter sur la situation à Berlin.

La colère et la frustration des passagers atteignent leur limite, au moment où Sam a une prise de conscience effrayante.

Pour éviter un nouveau désastre, Sam doit collaborer avec un allié improbable. L'ennemi se rapproche de Marsha tandis que Zahra et Daniel se heurtent à une impasse.

Sam mise tout sur une stratégie risquée dans l'espoir de tromper la police. Olivia, en possession de nouvelles informations, tente d'influencer la prochaine décision de Winter.

Fin de saison. Alors que l’échange est imminent, Sam est prêt à risquer sa vie pour sauver Marsha et faire éclater la vérité.