La découverte de deux pilotes de la Navy disparus dans la mer de Corail amène l'équipe à révéler un complot terroriste.

Inquiet pour Blue, le Doc pénètre par effraction dans son appartement où DeShawn et Evie font une découverte choquante sur un membre de l'équipe.

La traque d'une cible de l'armée américaine prend une tournure inattendue quand le suspect, accusé d'avoir tué un soldat australien, affirme avoir la preuve d'un crime de guerre.

Quand une pilote de l'U.S. Navy disparaît dans une zone prisée des chasseurs d'ovnis après avoir été poursuivie par des lueurs aveuglantes, l'équipe se rend dans l'Outback pour découvrir si " la vérité est ailleurs ".

Lorsqu'un attaché de l'US Navy est retrouvé mort avec une clé USB logée dans la gorge, l'équipe traque un tueur soupçonné d'avoir des liens avec un tournoi international d'échecs à Sydney.

Face au premier cas d'Ébola en Australie, l'équipe mène une course contre-la-montre pour découvrir comment le patient zéro – un scientifique de l'U.S Navy – a contracté le virus. Leur mission est compliquée par une agence militaire top-secrète.

Lorsqu'un officier de la Navy est arrêté alors qu'il tentait de détruire une carte au trésor, l'équipe se lance dans une chasse afin de retrouver le légendaire "trésor de Yamashita".

Quand un marin américain accusé de meurtre est abattu, l'équipe découvre qu'il était le sujet d'un podcast à succès sur une affaire criminelle non résolue et cherche à savoir si un fan de l'émission a décidé de faire justice lui-même.

L'équipe se rend dans une base de recherche en Antarctique pour comprendre pourquoi un climatologue a tué un de ses collègues – et doit en repartir avant que le moteur de leur avion ne gèle.

Mackey est secrètement engagée pour enquêter sur la disparition du fils du patron et de sa petite-amie. Quand le corps de cette dernière est retrouvé dans leur van, toute l'équipe se mobilise pour localiser le jeune homme.

L'équipe enquête sur la mort suspecte d'un officier de la NAVY qui venait d'apprendre qu'il allait devenir père, ce qui conduit à la découverte d'un secret.

L'équipe enquête sur une explosion ayant décimé une unité de démineurs qui ont des liens avec eux.

Alors que de nombreuses vies sont en danger, y compris les leurs, l'équipe se démène pour arrêter la trajectoire destructrice d'un poseur de bombe.

L'équipe plonge dans le monde occulte de la cartomancie quand on trouve près du corps d'un marin de l'U.S Navy une carte de tarot décrivant les circonstances exactes de sa mort.

Lorsqu'un Marine lié à la mission de sauvetage ratée de Mackey en Afghanistan est retrouvé mort, d'anciens ennemis refont surface et la personne qui lui est la plus chère est menacée.

Des vies sont en jeu quand le bloc opératoire d'un hôpital est pris en otage et que l'équipe doit faire face à un dilemme insoluble.

Quand un drone militaire de haute technologie tue une adolescente, l'équipe doit infiltrer le monde des gamers d'élite.

La mort d'un ancien marine recherché pour meurtre amène l'équipe à enquêter sur une journaliste déchue, un des hommes les plus riches d'Australie et des diamants de synthèse.

Quand agent du FBI est tué aux Fidji l'équipe est à nouveau confronté au Collectif , et Mackey doitt affronter une situation familial imprévue, dans la première partie du final de la saison.

L'équipe mène la bataille d'une vie pour arrêter le Collectif et sauver ceux qu'ils aiment dans la deuxième partie du double épisode final de la saison.