Six mois ont passé. Ruzek est encore en convalescence. Au cours d'une journée d'observation dans le cadre d'un programme de déjudiciarisation pour travailleurs sociaux, Upton est confrontée à des difficultés dans le traitement d'un dossier en raison des changements incessants dans sa vie personnelle...

Toujours en congé maladie, Ruzek est impliqué bien malgré lui dans une affaire après un vol lors d'une partie de poker nocturne. Tout l'argent mis en jeu a disparu.

Alors qu'il fait des heures supplémentaires au sein du 13e District, Burgess se retrouve pris au milieu d'une attaque contre un centre d'hébergement pour sans-abri. L'équipe se lance à la recherche du tireur. Après la fin de sa rééducation, Ruzek reprend son poste au service de renseignement...

De retour de congé, Torres doit enquêter sous couverture sur une affaire de trafic de drogue. Mais l'infiltration va être beaucoup plus complexe qu'il n'y paraît.

Après une série de braquages de bijouterie qui a fait une victime, Atwater se tourne vers un soutien inattendu car cette affaire ébranle sa confiance.

L'unité de renseignement enquête sur l'enlèvement et la torture d'un adolescent sans-abri. Tous les éléments indiquent qu'il s'agit d'un crime homophobe. Voight apprend que la famille de la victime l'a reniée parce qu'il est gay et fait de ce dossier une affaire personnelle...

Après que deux autres victimes ont été retrouvées, l'unité de renseignement sait maintenant qu'elle a affaire à un tueur en série. Voight tente de convaincre Noah de parler de son traumatisme et de ce qui lui est arrivé pour l'aider à résoudre cette enquête...

Alors que l'enquête sur le tueur en série atteint un point critique, l'équipe se penche sur une nouvelle affaire, l'enlèvement d'un nourrisson. Upton fait appel à Josephine Petrovic, une profileuse de l'unité spéciale pour les victimes qui, pour une raison qu'elle ignore, ne travaille jamais sur le terrain...

L'unité de renseignement poursuit ses investigations sur le réseau de trafic de drogue. Alors qu'il enquête sous couverture, Torres se retrouve dans une situation délicate. Burgess a en effet découvert qu'il entretient une relation amoureuse avec une informatrice...

Alors que Voight est en déplacement, Upton prend temporairement la tête de l'unité de renseignement. Lorsqu'une nouvelle piste concernant une vieille affaire de disparition fait surface, Upton fait appel à Petrovic, mais l'alcoolisme de la profileuse pousse la policière à prendre une décision radicale...

Quand Voight rentre à Chicago, l'unité est en train d'enquêter sur une série de braquages violents. Un des informateurs d'Atwater semble détenir des informations capitales sur l'affaire. Le sentiment de culpabilité d'Atwater concernant une affaire passée affecte son travail...

Les services de renseignement suivent une piste intéressante et particulièrement prometteuse dans le cadre de leur enquête en cours sur un tueur en série. Quand l'affaire est portée à la connaissance du grand public, il leur faut agir le plus vite possible pour arrêter les agissements délétères du meurtrier et éviter de ternir l'image des forces de l'ordre...

L'unité de renseignement se lance dans une course contre la montre pour retrouver Voight après qu'il a été kidnappé par Frank Matson, le tueur en série sur lequel ils enquêtaient. Pendant ce temps, Upton s'apprête à prendre une décision importante pour son avenir...