La relation de Shaun et Lea est mise à l'épreuve. Park s'apprête à repartir à Phoenix. En prenant une décision malheureuse, non seulement Morgan se met en danger mais elle fait également courir des risques à une partie de l'équipe de soignants. Claire est toujours en deuil après le décès de Melendez...

Les semaines se suivent et la crise sanitaire continue. Claire tente par tous les moyens de retrouver le propriétaire d'un objet trouvé à l'hôpital, persuadée que cela apporterait réconfort à ses proches. Park fait le point avec son fils et sa femme sur leur situation. Glassman se réconcilie avec Debbie...

Lim charge Shaun, Claire et Park du suivi des meilleurs médecins-résidents en première année de stage hospitalier. Andrews discute d'une opération délicate à venir. Morgan demande de l'aide à Claire et Lim lors d'une consultation...

Une des patientes de Morgan et Shaun, qui est enceinte de jumeaux, ressent de très fortes douleurs. Les deux médecins sont amenés à prendre une décision qu'ils espéraient éviter. Shaun demande à Lea de revenir vivre chez lui...

Claire, Park, Enrique et Jordan s'occupent d'Ellie, une patiente qui souffre de migraine. Lorsque son état s'aggrave, ils doivent composer avec le mari d'Ellie et son amant. Lors d'un examen abdominal pour une douleur dorsale, Asher passe à côté d'un anévrisme. Le patient finit par mourir de complications...

Le service tente de soigner Ben, un ancien soldat revenu d'Afghanistan hanté par son passé, ainsi que Rose, une vieille dame dont l'empathie surdéveloppée fascine le service. Lim est en proie à ce qui ressemble à un syndrome posttraumatique. Lim fait une pointe de vitesse en moto et fait une chute...

Shaun est perturbé par une proposition de Léa de faire l'amour sous la douche. Comme d'habitude, il recueille les avis de ses collègues. Claire, Jordan et Olivia prennent en charge Hannah, en rémission de deux cancers différents, pour un hématome consécutif à une chute de ski...

Les parents de Léa débarquent en ville. Shaun se prépare à les recevoir car il veut faire bonne impression. Toujours atteinte de stress post-traumatique, Lim sombre de plus en plus, et refuse l'aide que Claire lui propose. Cette dernière ne voit pas d'autre solution que d'en parler à Glassman.

Le docteur Lim prend en charge une patiente enceinte qui souffre d'un cancer. De son côté, Claire se trompe dans le diagnostic d'un patient. A cette occasion, elle découvre avec surprise certaines pratiques de l'hôpital...

L'hôpital est victime d'une cyberattaque aux conséquences désastreuses. Lea prend les choses en main et cherche à déjouer les pirates informatiques.

Alors qu'il se prépare pour une opération de la colonne vertébrale inédite et incroyablement compliquée, le docteur Aaron Glassman propose aux résidents de le rejoindre dans la salle d'opération. Pendant ce temps, Shaun et Morgan sont en désaccord sur la façon de traiter un patient comateux atteint d'une tumeur cancéreuse...

Lorsqu'un chirurgien de renom se présente à St. Bonaventure pour un traitement, l'enthousiasme de l'équipe est rapidement éclipsé par le comportement du médecin. Après avoir étudié son cas, le docteur Murphy voit une tendance qu'il reconnaît. Pendant ce temps, Shaun et Lea sont forcés de prendre une décision qui va changer le cours de leur relation.

Claire est prise au dépourvu lorsque son père se présente à sa porte. Shaun se sent déconnecté de Lea, ce qui provoque des tensions dans leur relation.

Shaun réalise qu'il doit faire un effort pour soutenir sa compagne pendant sa grossesse. L'équipe prend en charge une pilote de l'armée victime d'un diagnostic erroné.

La ville est le théâtre d'une manifestation politique. Peu à peu, l'ambiance s'est dégradée, jusqu'à faire tourner toute l'affaire à l'émeute. Des coups de feu sont échangés. Deux personnes se retrouvent au sol. L'équipe du docteur Murphy se précipite pour tenter de sauver les deux malheureuses victimes...

La grossesse de Lea ne se passe pas aussi bien qu'espérée. Face à ces complications, Shaun ne sait pas comment réagir pour soutenir sa compagne. De leur côté, Park, Andrews et Asher sont en désaccord sur la façon de répondre aux souhaits d'un patient âgé...

La nouvelle patiente prise en charge par Claire Brown est une de ses idoles. Les décisions du médecin sont influencées par son admiration pour sa malade. Subitement, les protocoles et les règles rigoureuses du métier lui paraissent secondaires. Est-elle en train de franchir une ligne rouge ?...

Shaun prend la décision d'emmener Lea en camping sauvage pour le week-end, car ils ont besoin de se distraire de leurs soucis. Le week-end est mouvementé et moins agréable que prévu. Sean fait une mauvaise chute et Lea doit lui faire une suture de fortune en pleine nature...

L'équipe de St. Bonaventure se rend au Guatemala pour une mission chirurgicale afin d'aider les patients dans un hôpital rural. L'équipe y fait face à une petite collectivité qui a désespérément besoin de son aide, mais qui se voit confier la tâche ardue d'identifier les personnes qu'elle peut le plus aider...

Toujours en mission au Guatemala, Shaun procède à une intervention chirurgicale délicate. Malheureusement, une panne de courant met en péril le succès de l'opération.